Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

LTBP1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

LTBP1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KSQ

Ідентифікатори

Символи

LTBP1, latent transforming growth factor beta binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM:150390 MGI:109151 HomoloGene:522 GeneCards:LTBP1

Пов'язані генетичні захворювання

натуральна віспа^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0001948, GO:0016582 protein binding •calcium ion binding •transforming growth factor beta-activated receptor activity •growth factor binding •microfibril binding •transforming growth factor beta binding •extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	•GO:0005578 Позаклітинна матриця •microfibril •міжклітинний простір •endoplasmic reticulum lumen •extracellular region •GO:0009327 protein-containing complex •collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	•ventricular septum development •sequestering of TGFbeta in extracellular matrix •coronary vasculature development •aorta development •transmembrane receptor protein serine/threonine kinase signaling pathway •посттрансляційна модифікація •regulation of transforming growth factor beta activation
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4052


268977

Ensembl


ENSG00000049323


ENSMUSG00000001870

UniProt


Q14766


Q8CG19

RefSeq (мРНК)


NM_000627 NM_001166264 NM_001166265 NM_001166266 NM_206943

NM_019919 NM_206958 NM_001331233 NM_001331234 NM_001331235
NM_001331236 NM_001331237

RefSeq (білок)


NP_000618 NP_001159736 NP_001159737 NP_001159738 NP_996826

NP_001318162 NP_001318163 NP_001318164 NP_001318165 NP_001318166
NP_064303 NP_996841

Локус (UCSC)

Хр. 2: 32.95 – 33.4 Mb

Хр. 17: 75.31 – 75.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LTBP1 (англ.Latent transforming growth factor beta binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 721амінокислот, амолекулярна маса — 186 796^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGAWLRWGL	LLWAGLLASS	AHGRLRRITY	VVHPGPGLAA	GALPLSGPPR
SRTFNVALNA	RYSRSSAAAG	APSRASPGVP	SERTRRTSKP	GGAALQGLRP
PPPPPPEPAR	PAVPGGQLHP	NPGGHPAAAP	FTKQGRQVVR	SKVPQETQSG
GGSRLQVHQK	QQLQGVNVCG	GRCCHGWSKA	PGSQRCTKPS	CVPPCQNGGM
CLRPQLCVCK	PGTKGKACET	IAAQDTSSPV	FGGQSPGAAS	SWGPPEQAAK
HTSSKKADTL	PRVSPVAQMT	LTLKPKPSVG	LPQQIHSQVT	PLSSQSVVIH
HGQTQEYVLK	PKYFPAQKGI	SGEQSTEGSF	PLRYVQDQVA	APFQLSNHTG
RIKVVFTPSI	CKVTCTKGSC	QNSCEKGNTT	TLISENGHAA	DTLTATNFRV
VICHLPCMNG	GQCSSRDKCQ	CPPNFTGKLC	QIPVHGASVP	KLYQHSQQPG
KALGTHVIHS	THTLPLTVTS	QQGVKVKFPP	NIVNIHVKHP	PEASVQIHQV
SRIDGPTGQK	TKEAQPGQSQ	VSYQGLPVQK	TQTIHSTYSH	QQVIPHVYPV
AAKTQLGRCF	QETIGSQCGK	ALPGLSKQED	CCGTVGTSWG	FNKCQKCPKK
PSYHGYNQMM	ECLPGYKRVN	NTFCQDINEC	QLQGVCPNGE	CLNTMGSYRC
TCKIGFGPDP	TFSSCVPDPP	VISEEKGPCY	RLVSSGRQCM	HPLSVHLTKQ
LCCCSVGKAW	GPHCEKCPLP	GTAAFKEICP	GGMGYTVSGV	HRRRPIHHHV
GKGPVFVKPK	NTQPVAKSTH	PPPLPAKEEP	VEALTFSREH	GPGVAEPEVA
TAPPEKEIPS	LDQEKTKLEP	GQPQLSPGIS	TIHLHPQFPV	VIEKTSPPVP
VEVAPEASTS	SASQVIAPTQ	VTEINECTVN	PDICGAGHCI	NLPVRYTCIC
YEGYRFSEQQ	RKCVDIDECT	QVQHLCSQGR	CENTEGSFLC	ICPAGFMASE
EGTNCIDVDE	CLRPDVCGEG	HCVNTVGAFR	CEYCDSGYRM	TQRGRCEDID
ECLNPSTCPD	EQCVNSPGSY	QCVPCTEGFR	GWNGQCLDVD	ECLEPNVCAN
GDCSNLEGSY	MCSCHKGYTR	TPDHKHCRDI	DECQQGNLCV	NGQCKNTEGS
FRCTCGQGYQ	LSAAKDQCED	IDECQHRHLC	AHGQCRNTEG	SFQCVCDQGY
RASGLGDHCE	DINECLEDKS	VCQRGDCINT	AGSYDCTCPD	GFQLDDNKTC
QDINECEHPG	LCGPQGECLN	TEGSFHCVCQ	QGFSISADGR	TCEDIDECVN
NTVCDSHGFC	DNTAGSFRCL	CYQGFQAPQD	GQGCVDVNEC	ELLSGVCGEA
FCENVEGSFL	CVCADENQEY	SPMTGQCRSR	TSTDLDVDVD	QPKEEKKECY
YNLNDASLCD	NVLAPNVTKQ	ECCCTSGVGW	GDNCEIFPCP	VLGTAEFTEM
CPKGKGFVPA	GESSSEAGGE	NYKDADECLL	FGQEICKNGF	CLNTRPGYEC
YCKQGTYYDP	VKLQCFDMDE	CQDPSSCIDG	QCVNTEGSYN	CFCTHPMVLD
ASEKRCIRPA	ESNEQIEETD	VYQDLCWEHL	SDEYVCSRPL	VGKQTTYTEC
CCLYGEAWGM	QCALCPLKDS	DDYAQLCNIP	VTGRRQPYGR	DALVDFSEQY
TPEADPYFIQ	DRFLNSFEEL	QAEECGILNG	CENGRCVRVQ	EGYTCDCFDG
YHLDTAKMTC	VDVNECDELN	NRMSLCKNAK	CINTDGSYKC	LCLPGYVPSD
KPNYCTPLNT	ALNLEKDSDL	E

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі якальтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Saharinen J., Hyytiainen M., Taipale J., Keski-Oja J. (1999).Latent transforming growth factor-beta binding proteins (LTBPs) --structural extracellular matrix proteins for targeting TGF-beta action.Cytokine Growth Factor Rev.10: 99—117.PMID 10743502doi:10.1016/S1359-6101(99)00010-6
Oklu R., Hesketh R. (2000). The latent transforming growth factor beta binding protein (LTBP) family.Biochem. J.352: 601—610.PMID 11104663doi:10.1042/bj3520601
Saharinen J., Keski-Oja J. (2000). Specific sequence motif of 8-Cys repeats of TGF-beta binding proteins, LTBPs, creates a hydrophobic interaction surface for binding of small latent TGF-beta.Mol. Biol. Cell.11: 2691—2704.PMID 10930463doi:10.1091/mbc.11.8.2691
Hirani R., Hanssen E., Gibson M.A. (2007). LTBP-2 specifically interacts with the amino-terminal region of fibrillin-1 and competes with LTBP-1 for binding to this microfibrillar protein.Matrix Biol.26: 213—223.PMID 17293099doi:10.1016/j.matbio.2006.12.006