KLF4 Ідентифікатори Символи KLF4 Зовнішні ІД OMIM :602253 MGI: 1342287 HomoloGene: 3123 GeneCards: KLF4 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • phosphatidylinositol 3-kinase regulator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв’язування з іоном металу • RNA polymerase II sequence-specific DNA-binding transcription factor recruiting activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • promoter-specific chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription coregulator binding • histone deacetylase binding
Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • хроматин • клітинне ядро
Біологічний процес • negative regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production • epidermal cell differentiation • cellular response to retinoic acid • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of muscle hyperplasia • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of axon regeneration • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process • response to retinoic acid • somatic stem cell population maintenance • cellular response to laminar fluid shear stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • epidermis morphogenesis • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • cellular response to growth factor stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • post-embryonic hemopoiesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • відгук на органічну речовину • negative regulation of gene expression • negative regulation of response to cytokine stimulus • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • stem cell population maintenance • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of cell migration • regulation of cell population proliferation • post-embryonic camera-type eye development • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of telomerase activity • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • регуляція диференціювання клітин • mesodermal cell fate determination • negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to cycloheximide • negative regulation of inflammatory response • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • negative regulation of leukocyte adhesion to arterial endothelial cell • positive regulation of core promoter binding • cellular response to leukemia inhibitory factor • negative regulation of angiogenesis • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of sprouting angiogenesis
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 9: 107.48 – 107.49 Mb Хр. 4: 55.53 – 55.53 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
KLF4 (англ. Kruppel like factor 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 54 671[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MRQPPGESDM AVSDALLPSF STFASGPAGR EKTLRQAGAP NNRWREELSH MKRLPPVLPG RPYDLAAATV ATDLESGGAG AACGGSNLAP LPRRETEEFN DLLDLDFILS NSLTHPPESV AATVSSSASA SSSSSPSSSG PASAPSTCSF TYPIRAGNDP GVAPGGTGGG LLYGRESAPP PTAPFNLADI NDVSPSGGFV AELLRPELDP VYIPPQQPQP PGGGLMGKFV LKASLSAPGS EYGSPSVISV SKGSPDGSHP VVVAPYNGGP PRTCPKIKQE AVSSCTHLGA GPPLSNGHRP AAHDFPLGRQ LPSRTTPTLG LEEVLSSRDC HPALPLPPGF HPHPGPNYPS FLPDQMQPQV PPLHYQGQSR GFVARAGEPC VCWPHFGTHG MMLTPPSSPL ELMPPGSCMP EEPKPKRGRR SWPRKRTATH TCDYAGCGKT YTKSSHLKAH LRTHTGEKPY HCDWDGCGWK FARSDELTRH YRKHTGHRPF QCQKCDRAFS RSDHLALHMK RHF
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Wei X., Xu H., Kufe D. (2007). Human mucin 1 oncoprotein represses transcription of the p53 tumor suppressor gene.Cancer Res .67 : 1853—1858. PMID 17308127 doi :10.1158/0008-5472.CAN-06-3063 Zhang P., Andrianakos R., Yang Y., Liu C., Lu W. (2010). Kruppel-like factor 4 (Klf4) prevents embryonic stem (ES) cell differentiation by regulating Nanog gene expression.J. Biol. Chem .285 : 9180—9189. PMID 20071344 doi :10.1074/jbc.M109.077958 Bjerke G.A., Hyman-Walsh C., Wotton D. (2011). Cooperative transcriptional activation by Klf4, Meis2, and Pbx1.Mol. Cell. Biol .31 : 3723—3733. PMID 21746878 doi :10.1128/MCB.01456-10
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
