IRF7 Ідентифікатори Символи IRF7 Зовнішні ІД OMIM :605047 MGI: 1859212 HomoloGene: 128624 GeneCards: IRF7 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента • нуклеоплазма • endosome membrane • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • regulation of adaptive immune response • response to virus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of type I interferon production • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • negative regulation of macrophage apoptotic process • type I interferon signaling pathway • immunoglobulin mediated immune response • establishment of viral latency • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • regulation of monocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of interferon-beta production • interferon-beta production • regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • interferon-alpha production • defense response to virus • регуляція експресії генів
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 11: 0.61 – 0.62 Mb Хр. 7: 140.84 – 140.85 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
IRF7 (англ. Interferon regulatory factor 7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 54 278[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MALAPERAAP RVLFGEWLLG EISSGCYEGL QWLDEARTCF RVPWKHFARK DLSEADARIF KAWAVARGRW PPSSRGGGPP PEAETAERAG WKTNFRCALR STRRFVMLRD NSGDPADPHK VYALSRELCW REGPGTDQTE AEAPAAVPPP QGGPPGPFLA HTHAGLQAPG PLPAPAGDKG DLLLQAVQQS CLADHLLTAS WGADPVPTKA PGEGQEGLPL TGACAGGPGL PAGELYGWAV ETTPSPGPQP AALTTGEAAA PESPHQAEPY LSPSPSACTA VQEPSPGALD VTIMYKGRTV LQKVVGHPSC TFLYGPPDPA VRATDPQQVA FPSPAELPDQ KQLRYTEELL RHVAPGLHLE LRGPQLWARR MGKCKVYWEV GGPPGSASPS TPACLLPRNC DTPIFDFRVF FQELVEFRAR QRRGSPRYTI YLGFGQDLSA GRPKEKSLVL VKLEPWLCRV HLEGTQREGV SSLDSSSLSL CLSSANSLYD DIECFLMELE QPA
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, якімунітет ,вроджений імунітет , взаємодія хазяїн-вірус ,транскрипція , регуляціятранскрипції , противірусний захист, ацетилювання,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі .
Zhang L., Pagano J.S. (1997).IRF-7, a new interferon regulatory factor associated with Epstein-Barr virus latency .Mol. Cell. Biol .17 : 5748—5757. PMID 9315633 doi :10.1128/MCB.17.10.5748 Au W.-C., Moore P.A., LaFleur D.W., Tombal B., Pitha P.M. (1998). Characterization of the interferon regulatory factor-7 and its potential role in the transcription activation of interferon A genes.J. Biol. Chem .273 : 29210—29217. PMID 9786932 doi :10.1074/jbc.273.44.29210 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Marie I.J., Smith E., Prakash A., Levy D.E. (2000).Phosphorylation-induced dimerization of interferon regulatory factor 7 unmasks DNA binding and a bipartite transactivation domain .Mol. Cell. Biol .20 : 8803—8814. PMID 11073981 doi :10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000 Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein.J. Biol. Chem .276 : 8951—8957. PMID 11124948 doi :10.1074/jbc.M008717200 Zhang L., Pagano J.S. (2002). Structure and function of IRF-7.J. Interferon Cytokine Res .22 : 95—101. PMID 11846980 doi :10.1089/107999002753452700
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
