Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

IRF3

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

IRF3

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QU6,1J2F,1QWT,1T2K,1ZOQ,2O61,2O6G,2PI0,3A77,5JEO,5JEK,5JER,5JEM,5JEL,5JEJ

Ідентифікатори

Символи

IRF3, entrez:3661, IIAE7, interferon regulatory factor 3

Зовнішні ІД

OMIM:603734 MGI:1859179 HomoloGene:1208 GeneCards:IRF3

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •protein homodimerization activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001104 transcription coregulator activity •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein domain specific binding •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •sequence-specific DNA binding •identical protein binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •нуклеоплазма •клітинне ядро •гіалоплазма
Біологічний процес	•GO:0097285 апоптоз •positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway •macrophage apoptotic process •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •response to bacterium •response to exogenous dsRNA •positive regulation of interferon-alpha production •MDA-5 signaling pathway •interferon-gamma-mediated signaling pathway •процес імунної системи •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •cellular response to dsRNA •transcription, DNA-templated •cellular response to DNA damage stimulus •TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway •response to lipopolysaccharide •defense response to virus •type I interferon signaling pathway •positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling •negative regulation of type I interferon production •programmed necrotic cell death •GO:0022415 viral process •cellular response to lipopolysaccharide •positive regulation of type I interferon production •lipopolysaccharide-mediated signaling pathway •positive regulation of interferon-beta production •вроджений імунітет •regulation of type I interferon production •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of defense response to virus by host •регуляція експресії генів •regulation of inflammatory response •cellular response to exogenous dsRNA •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3661


54131

Ensembl


ENSG00000126456


ENSMUSG00000003184

UniProt


Q14653


P70671

RefSeq (мРНК)

NM_001197122 NM_001197123 NM_001197124 NM_001197125 NM_001197126
NM_001197127 NM_001197128 NM_001571


NM_016849

RefSeq (білок)

NP_001184051 NP_001184052 NP_001184053 NP_001184054 NP_001184055
NP_001184056 NP_001184057 NP_001562 NP_001184053.1 NP_001184056.1 NP_001184057.1


NP_058545

Локус (UCSC)

Хр. 19: 49.66 – 49.67 Mb

Хр. 7: 44.65 – 44.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IRF3 (англ.Interferon regulatory factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427амінокислот, амолекулярна маса — 47 219^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTPKPRILP	WLVSQLDLGQ	LEGVAWVNKS	RTRFRIPWKH	GLRQDAQQED
FGIFQAWAEA	TGAYVPGRDK	PDLPTWKRNF	RSALNRKEGL	RLAEDRSKDP
HDPHKIYEFV	NSGVGDFSQP	DTSPDTNGGG	STSDTQEDIL	DELLGNMVLA
PLPDPGPPSL	AVAPEPCPQP	LRSPSLDNPT	PFPNLGPSEN	PLKRLLVPGE
EWEFEVTAFY	RGRQVFQQTI	SCPEGLRLVG	SEVGDRTLPG	WPVTLPDPGM
SLTDRGVMSY	VRHVLSCLGG	GLALWRAGQW	LWAQRLGHCH	TYWAVSEELL
PNSGHGPDGE	VPKDKEGGVF	DLGPFIVDLI	TFTEGSGRSP	RYALWFCVGE
SWPQDQPWTK	RLVMVKVVPT	CLRALVEMAR	VGGASSLENT	VDLHISNSHP
LSLTSDQYKA	YLQDLVEGMD	FQGPGES

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, якімунітет,вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус,транскрипція, регуляціятранскрипції, противірусний захист,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Au W.W.-C., Moore P.P.A., Lowther W.W., Juang Y.-T., Pitha P.M. (1995). Identification of a member of the interferon regulatory factor family that binds to the interferon-stimulated response element and activates expression of interferon-induced genes.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.92: 11657—11661.PMID 8524823doi:10.1073/pnas.92.25.11657
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans C.Y. (1998).Mapping of human interferon regulatory factor 3 (IRF3) to chromosome 19q13.3-13.4 by an intragenic polymorphic marker.Ann. Hum. Genet.62: 231—234.PMID 9803267doi:10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x
Lin R., Heylbroeck C., Pitha P.M., Hiscott J. (1998).Virus-dependent phosphorylation of the IRF-3 transcription factor regulates nuclear translocation, transactivation potential, and proteasome-mediated degradation.Mol. Cell. Biol.18: 2986—2996.PMID 9566918doi:10.1128/MCB.18.5.2986
Kumar K.P., McBride K.M., Weaver B.K., Dingwall C., Reich N.C. (2000).Regulated nuclear-cytoplasmic localization of interferon regulatory factor 3, a subunit of double-stranded RNA-activated factor 1.Mol. Cell. Biol.20: 4159—4168.PMID 10805757doi:10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000
Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein.J. Biol. Chem.276: 8951—8957.PMID 11124948doi:10.1074/jbc.M008717200

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6118 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q14653 (англ.) . Архіворигіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 19

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=IRF3&oldid=46336949

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭