HOXD10 Ідентифікатори Символи HOXD10 Зовнішні ІД OMIM :142984 MGI: 96202 HomoloGene: 1619 GeneCards: HOXD10 Пов'язані генетичні захворювання бічний аміотрофічний склероз ,rocker bottom foot [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • forelimb morphogenesis • peripheral nervous system neuron development • skeletal system development • proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord motor neuron cell fate specification • adult locomotory behavior • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • multicellular organism development • neuromuscular process • embryonic limb morphogenesis • регуляція експресії генів • skeletal muscle tissue development • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 2: 176.11 – 176.12 Mb Хр. 2: 74.52 – 74.53 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
HOXD10 (англ. Homeobox D10 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 38 411[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSFPNSSPAA NTFLVDSLIS ACRSDSFYSS SASMYMPPPS ADMGTYGMQT CGLLPSLAKR EVNHQNMGMN VHPYIPQVDS WTDPNRSCRI EQPVTQQVPT CSFTTNIKEE SNCCMYSDKR NKLISAEVPS YQRLVPESCP VENPEVPVPG YFRLSQTYAT GKTQEYNNSP EGSSTVMLQL NPRGAAKPQL SAAQLQMEKK MNEPVSGQEP TKVSQVESPE AKGGLPEERS CLAEVSVSSP EVQEKESKEE IKSDTPTSNW LTAKSGRKKR CPYTKHQTLE LEKEFLFNMY LTRERRLEIS KSVNLTDRQV KIWFQNRRMK LKKMSRENRI RELTANLTFS
Кодований геном білок за функціями належить добілків розвитку ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Redline R.W., Williams A.J., Patterson P., Collins T. (1992). Human HOX4E: a gene strongly expressed in the adult male and female urogenital tracts.Genomics .13 : 425—430. PMID 1351871 doi :10.1016/0888-7543(92)90263-R The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
