Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

HIVEP3

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

HIVEP3

Ідентифікатори

Символи

HIVEP3, Hivep3, 2900056N03Rik, A130075N07, AI848000, E030045D18Rik, KBP-1, KBP1, Rc, Schnurri-3, Shn3, Zas3, ZNF40C, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, Kappa Recognition Component (Krc), KRC, HIVEP zinc finger 3

Зовнішні ІД

OMIM:606649 MGI:106589 HomoloGene:7803 GeneCards:HIVEP3

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •sequence-specific DNA binding •DNA binding •зв’язування з іоном металу •nucleic acid binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •клітинне ядро
Біологічний процес	•multicellular organism development •skeletal muscle cell differentiation •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •transcription by RNA polymerase II •GO:0072468 сигнальна трансдукція •transcription, DNA-templated •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


59269


16656

Ensembl


ENSG00000127124


ENSMUSG00000028634

UniProt


Q5T1R4


A2A884

RefSeq (мРНК)


NM_001127714 NM_024503


NM_010657

RefSeq (білок)


NP_001121186 NP_078779


NP_034787

Локус (UCSC)

Хр. 1: 41.51 – 42.04 Mb

Хр. 4: 119.59 – 120 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIVEP3 (англ.Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 406амінокислот, амолекулярна маса — 259 465^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPEQSVKGT	KKAEGSPRKR	LTKGEAIQTS	VSSSVPYPGS	GTAATQESPA
QELLAPQPFP	GPSSVLREGS	QEKTGQQQKP	PKRPPIEASV	HISQLPQHPL
TPAFMSPGKP	EHLLEGSTWQ	LVDPMRPGPS	GSFVAPGLHP	QSQLLPSHAS
IIPPEDLPGV	PKVFVPRPSQ	VSLKPTEEAH	KKERKPQKPG	KYICQYCSRP
CAKPSVLQKH	IRSHTGERPY	PCGPCGFSFK	TKSNLYKHRK	SHAHRIKAGL
ASGMGGEMYP	HGLEMERIPG	EEFEEPTEGE	STDSEEETSA	TSGHPAELSP
RPKQPLLSSG	LYSSGSHSSS	HERCSLSQSS	TAQSLEDPPP	FVEPSSEHPL
SHKPEDTHTI	KQKLALRLSE	RKKVIDEQAF	LSPGSKGSTE	SGYFSRSESA
EQQVSPPNTN	AKSYAEIIFG	KCGRIGQRTA	MLTATSTQPL	LPLSTEDKPS
LVPLSVPRTQ	VIEHITKLIT	INEAVVDTSE	IDSVKPRRSS	LSRRSSMESP
KSSLYREPLS	SHSEKTKPEQ	SLLSLQHPPS	TAPPVPLLRS	HSMPSAACTI
STPHHPFRGS	YSFDDHITDS	EALSHSSHVF	TSHPRMLKRQ	PAIELPLGGE
YSSEEPGPSS	KDTASKPSDE	VEPKESELTK	KTKKGLKTKG	VIYECNICGA
RYKKRDNYEA	HKKYYCSELQ	IAKPISAGTH	TSPEAEKSQI	EHEPWSQMMH
YKLGTTLELT	PLRKRRKEKS	LGDEEEPPAF	ESTKSQFGSP	GPSDAARNLP
LESTKSPAEP	SKSVPSLEGP	TGFQPRTPKP	GSGSESGKER	RTTSKEISVI
QHTSSFEKSD	SLEQPSGLEG	EDKPLAQFPS	PPPAPHGRSA	HSLQPKLVRQ
PNIQVPEILV	TEEPDRPDTE	PEPPPKEPEK	TEEFQWPQRS	QTLAQLPAEK
LPPKKKRLRL	AEMAQSSGES	SFESSVPLSR	SPSQESNVSL	SGSSRSASFE
RDDHGKAEAP	SPSSDMRPKP	LGTHMLTVPS	HHPHAREMRR	SASEQSPNVS
HSAHMTETRS	KSFDYGSLSL	TGPSAPAPVA	PPARVAPPER	RKCFLVRQAS
LSRPPESELE	VAPKGRQESE	EPQPSSSKPS	AKSSLSQISS	AATSHGGPPG
GKGPGQDRPP	LGPTVPYTEA	LQVFHHPVAQ	TPLHEKPYLP	PPVSLFSFQH
LVQHEPGQSP	EFFSTQAMSS	LLSSPYSMPP	LPPSLFQAPP	LPLQPTVLHP
GQLHLPQLMP	HPANIPFRQP	PSFLPMPYPT	SSALSSGFFL	PLQSQFALQL
PGDVESHLPQ	IKTSLAPLAT	GSAGLSPSTE	YSSDIRLPPV	APPASSSAPT
SAPPLALPAC	PDTMVSLVVP	VRVQTNMPSY	GSAMYTTLSQ	ILVTQSQGSS
ATVALPKFEE	PPSKGTTVCG	ADVHEVGPGP	SGLSEEQSRA	FPTPYLRVPV
TLPERKGTSL	SSESILSLEG	SSSTAGGSKR	VLSPAGSLEL	TMETQQQKRV
KEEEASKADE	KLELVKPCSV	VLTSTEDGKR	PEKSHLGNQG	QGRRELEMLS
SLSSDPSDTK	EIPPLPHPAL	SHGTAPGSEA	LKEYPQPSGK	PHRRGLTPLS
VKKEDSKEQP	DLPSLAPPSS	LPLSETSSRP	AKSQEGTDSK	KVLQFPSLHT
TTNVSWCYLN	YIKPNHIQHA	DRRSSVYAGW	CISLYNPNLP	GVSTKAALSL
LRSKQKVSKE	TYTMATAPHP	EAGRLVPSSS	RKPRMTEVHL	PSLVSPEGQK
DLARVEKEEE	RRGEPEEDAP	ASQRGEPARI	KIFEGGYKSN	EEYVYVRGRG
RGKYVCEECG	IRCKKPSMLK	KHIRTHTDVR	PYVCKHCHFA	FKTKGNLTKH
MKSKAHSKKC	QETGVLEELE	AEEGTSDDLF	QDSEGREGSE	AVEEHQFSDL
EDSDSDSDLD	EDEDEDEEES	QDELSRPSSE	APPPGPPHAL	RADSSPILGP
QPPDAPASGT	EATRGSSVSE	AERLTASSCS	MSSQSMPGLP	WLGPAPLGSV
EKDTGSALSY	KPVSPRRPWS	PSKEAGSRPP	LARKHSLTKN	DSSPQRCSPA
REPQASAPSP	PGLHVDPGRG	MGALPCGSPR	LQLSPLTLCP	LGRELAPRAH
VLSKLEGTTD	PGLPRYSPTR	RWSPGQAESP	PRSAPPGKWA	LAGPGSPSAG
EHGPGLGLDP	RVLFPPAPLP	HKLLSRSPET	CASPWQKAES	RSPSCSPGPA
HPLSSRPFSA	LHDFHGHILA	RTEENIFSHL	PLHSQHLTRA	PCPLIPIGGI
QMVQARPGAH	PTLLPGPTAA	WVSGFSGGGS	DLTGAREAQE	RGRWSPTESS
SASVSPVAKV	SKFTLSSELE	GGDYPKERER	TGGGPGRPPD	WTPHGTGAPA
EPTPTHSPCT	PPDTLPRPPQ	GRRAAQSWSP	RLESPRAPTN	PEPSATPPLD
RSSSVGCLAE	ASARFPARTR	NLSGEPRTRQ	DSPKPSGSGE	PRAHPHQPED
RVPPNA

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції, поліморфізм,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Hicar M.D., Liu Y., Allen C.E., Wu L.-C. (2001). Structure of the human zinc finger protein HIVEP3: molecular cloning, expression, exon-intron structure, and comparison with paralogous genes HIVEP1 and HIVEP2.Genomics.71: 89—100.PMID 11161801doi:10.1006/geno.2000.6425
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.DNA Res.7: 273—281.PMID 10997877doi:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13561 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q5T1R4 (англ.) . Архіворигіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 1

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=HIVEP3&oldid=46336727

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭