Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

HEY2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

HEY2

Ідентифікатори

Символи

HEY2, CHF1, GRIDLOCK, GRL, HERP1, HESR2, HRT2, bHLHb32, hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2

Зовнішні ІД

OMIM:604674 MGI:1341884 HomoloGene:22705 GeneCards:HEY2

Онтологія гена
Молекулярна функція	•microsatellite binding •sequence-specific DNA binding •DNA binding •protein dimerization activity •protein homodimerization activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •transcription factor binding •histone deacetylase binding •GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein heterodimerization activity •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001106 transcription corepressor activity •sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •transcription repressor complex •Sin3 complex •нуклеоплазма •клітинне ядро
Біологічний процес	•dorsal aorta morphogenesis •cardiac vascular smooth muscle cell development •cochlea development •pattern specification process •cell fate commitment •pulmonary valve morphogenesis •regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation •negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in smooth muscle cell differentiation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •heart trabecula formation •tricuspid valve morphogenesis •regulation of vasculogenesis •pulmonary artery morphogenesis •cardiac septum morphogenesis •negative regulation of cardiac vascular smooth muscle cell differentiation •muscular septum morphogenesis •ventricular septum morphogenesis •protein-DNA complex assembly •cardiac muscle hypertrophy •outflow tract morphogenesis •ascending aorta morphogenesis •cardiac left ventricle morphogenesis •labyrinthine layer blood vessel development •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •coronary vasculature morphogenesis •smooth muscle cell differentiation •negative regulation of gene expression •endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation •transcription, DNA-templated •ventricular trabecula myocardium morphogenesis •positive regulation of heart rate •васкулогенез •multicellular organism development •atrial septum morphogenesis •negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process •development of the heart •arterial endothelial cell differentiation •positive regulation of cardiac muscle cell proliferation •blood vessel development •cardiac muscle hypertrophy in response to stress •umbilical cord morphogenesis •negative regulation of transcription regulatory region DNA binding •mesenchymal cell development •artery development •регуляція експресії генів •negative regulation of transcription by transcription factor localization •negative regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter •vascular associated smooth muscle cell development •anterior/posterior axis specification •tricuspid valve formation •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •cardiac ventricle morphogenesis •cardiac right ventricle morphogenesis •ventricular cardiac muscle cell development •atrioventricular valve development •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of Notch signaling pathway •cardiac epithelial to mesenchymal transition •Notch signaling involved in heart development •Сигнальний шлях Notch •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •диференціація клітин •regulation of neurogenesis •aortic valve morphogenesis •epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation •GO:1901313 positive regulation of gene expression •negative regulation of biomineral tissue development •anterior/posterior pattern specification •circulatory system development
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23493


15214

Ensembl


ENSG00000135547


ENSMUSG00000019789

UniProt


Q9UBP5 Q5TF93


Q9QUS4

RefSeq (мРНК)


NM_012259


NM_013904

RefSeq (білок)


NP_036391


NP_038932

Локус (UCSC)

Хр. 6: 125.75 – 125.76 Mb

Хр. 10: 30.71 – 30.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HEY2 (англ.Hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 337амінокислот, амолекулярна маса — 35 808^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRPCEETTS	ESDMDETIDV	GSENNYSGQS	TSSVIRLNSP	TTTSQIMARK
KRRGIIEKRR	RDRINNSLSE	LRRLVPTAFE	KQGSAKLEKA	EILQMTVDHL
KMLQATGGKG	YFDAHALAMD	FMSIGFRECL	TEVARYLSSV	EGLDSSDPLR
VRLVSHLSTC	ATQREAAAMT	SSMAHHHHPL	HPHHWAAAFH	HLPAALLQPN
GLHASESTPC	RLSTTSEVPP	AHGSALLTAT	FAHADSALRM	PSTGSVAPCV
PPLSTSLLSL	SATVHAAAAA	ATAAAHSFPL	SFAGAFPMLP	PNAAAAVAAA
TAISPPLSVS	ATSSPQQTSS	GTNNKPYRPW	GTEVGAF

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів,білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Leimeister C., Externbrinck A., Klamt B., Gessler M. (1999).Hey genes: a novel subfamily of hairy- and enhancer of split related genes specifically expressed during mouse embryogenesis.Mech. Dev.85: 173—177.PMID 10415358doi:10.1016/S0925-4773(99)00080-5
Zhong T.P., Rosenberg M., Mohideen M.-A.P.K., Weinstein B., Fishman M.C. (2000).Gridlock, an HLH gene required for assembly of the aorta in zebrafish.Science.287: 1820—1824.PMID 10710309doi:10.1126/science.287.5459.1820
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Shirvani S., Xiang F., Koibuchi N., Chin M.T. (2006). CHF1/Hey2 suppresses SM-MHC promoter activity through an interaction with GATA-6.Biochem. Biophys. Res. Commun.339: 151—156.PMID 16293227doi:10.1016/j.bbrc.2005.10.190
Reamon-Buettner S.M., Borlak J. (2006). HEY2 mutations in malformed hearts.Hum. Mutat.27: 118—118.PMID 16329098doi:10.1002/humu.9390

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4881 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q9UBP5 (англ.) . Архіворигіналу за 15 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 6

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=HEY2&oldid=46719465

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭