| HAND2 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | HAND2, DHed, Thing2, bHLHa26, dHand, heart and neural crest derivatives expressed 2 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM:602407MGI:103580HomoloGene:32092GeneCards:HAND2 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | •DNA binding •sequence-specific DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •protein homodimerization activity •protein dimerization activity •minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding •GO:0001105 transcription coactivator activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •transcription factor binding •E-box binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein heterodimerization activity •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента | •transcription regulator complex •клітинне ядро •GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес | •positive regulation of transcription regulatory region DNA binding •peripheral nervous system neuron development •roof of mouth development •apoptotic process involved in heart morphogenesis •noradrenergic neuron differentiation •диференціація клітин •mesenchymal cell proliferation •determination of heart left/right asymmetry •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •sympathetic nervous system development •tongue development •neural crest cell development •cell proliferation involved in outflow tract morphogenesis •adult heart development •cardiac right ventricle formation •thymus development •mesenchyme development •cardiac neural crest cell migration involved in outflow tract morphogenesis •negative regulation of DNA binding •coronary artery morphogenesis •embryonic digit morphogenesis •positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in norepinephrine biosynthetic process •visceral serous pericardium development •heart morphogenesis •negative regulation of apoptotic process •in utero embryonic development •negative regulation of DNA-binding transcription factor activity •negative regulation of osteoblast differentiation •transcription, DNA-templated •cardiac neural crest cell development involved in outflow tract morphogenesis •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •heart looping •odontogenesis of dentin-containing tooth •positive regulation of semaphorin-plexin signaling pathway involved in outflow tract morphogenesis •multicellular organism development •negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process •development of the heart •regulation of secondary heart field cardioblast proliferation •Ангіогенез •cartilage morphogenesis •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •suckling behavior •regulation of tissue remodeling •negative regulation of gene expression •positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade •positive regulation of p38MAPK cascade •positive regulation of cardiac muscle hypertrophy •GO:1901313 positive regulation of gene expression •transcription by RNA polymerase II •primary palate development
|
|---|
| Джерела:Amigo /QuickGO |
|
| Шаблонекспресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 4: 173.52 – 173.53 Mb | Хр. 8: 57.77 – 57.78 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HAND2 (англ.Heart and neural crest derivatives expressed 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217амінокислот, амолекулярна маса — 23 666[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
| MSLVGGFPHH | | PVVHHEGYPF | | AAAAAAAAAA | | AASRCSHEEN | | PYFHGWLIGH |
| PEMSPPDYSM | | ALSYSPEYAS | | GAAGLDHSHY | | GGVPPGAGPP | | GLGGPRPVKR |
| RGTANRKERR | | RTQSINSAFA | | ELRECIPNVP | | ADTKLSKIKT | | LRLATSYIAY |
| LMDLLAKDDQ | | NGEAEAFKAE | | IKKTDVKEEK | | RKKELNEILK | | STVSSNDKKT |
| KGRTGWPQHV | | WALELKQ |
Кодований геном білок за функцією належить добілків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції,ангіогенез, диференціація,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.
Є представником родини білків HAND разом з білкомHAND1.
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1)Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1)Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|