Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

GLI3

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

GLI3

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
4BLD

Ідентифікатори

Символи

GLI3, ACLS, GCPS, GLI3-190, GLI3FL, PAP-A, PAPA, PAPA1, PAPB, PHS, PPDIV, GLI family zinc finger 3

Зовнішні ІД

OMIM:165240 MGI:95729 HomoloGene:139 GeneCards:GLI3

Пов'язані генетичні захворювання

макулодистрофія,поліноз,Greig cephalopolysyndactyly syndrome,Pallister-Hall syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •histone deacetylase binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •зв'язування з іоном металу •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •beta-catenin binding •chromatin binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •histone acetyltransferase binding •nucleic acid binding •DNA binding •sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •mediator complex binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •гіалоплазма •transcription repressor complex •клітинне ядро •nuclear speck •cell projection •mediator complex •війка •GO:0035085 Аксонема •нуклеоплазма •ciliary base •ciliary tip
Біологічний процес	•embryonic skeletal system morphogenesis •pattern specification process •lateral semicircular canal development •negative regulation of neuron differentiation •T cell differentiation in thymus •tongue development •nose morphogenesis •optic nerve morphogenesis •smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord interneuron specification •anatomical structure formation involved in morphogenesis •oligodendrocyte differentiation •hindgut morphogenesis •spinal cord dorsal/ventral patterning •thymocyte apoptotic process •mammary gland development •limb development •odontogenesis of dentin-containing tooth •positive regulation of chondrocyte differentiation •embryonic digestive tract morphogenesis •inner ear development •metanephros development •melanocyte differentiation •negative regulation of canonical Wnt signaling pathway •negative regulation of cell population proliferation •regulation of apoptotic process •positive regulation of neuroblast proliferation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •limb morphogenesis •negative regulation of smoothened signaling pathway •розвиток нирки •lung development •tube development •embryonic organ development •lateral ganglionic eminence cell proliferation •negative regulation of cell differentiation •embryonic digit morphogenesis •negative regulation of alpha-beta T cell differentiation •in utero embryonic development •transcription, DNA-templated •negative thymic T cell selection •GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated •heart development •central nervous system development •telencephalon development •branching involved in ureteric bud morphogenesis •embryonic limb morphogenesis •neural tube development •positive regulation of protein import into nucleus •smoothened signaling pathway •camera-type eye development •spinal cord motor neuron differentiation •positive regulation of alpha-beta T cell differentiation •lambdoid suture morphogenesis •regulation of bone development •roof of mouth development •proximal/distal pattern formation •GO:1903374 anatomical structure development •Загоєння ран •negative regulation of apoptotic process •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •response to estrogen •cerebral cortex radial glia-guided migration •positive regulation of osteoblast differentiation •developmental growth •pallium development •mammary gland specification •frontal suture morphogenesis •anterior semicircular canal development •регуляція експресії генів •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •dorsal/ventral pattern formation •branching morphogenesis of an epithelial tube •embryonic digestive tract development •subpallium development •sagittal suture morphogenesis •forebrain dorsal/ventral pattern formation •protein processing •axon guidance •brain development •smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning •forebrain radial glial cell differentiation •regulation of cell population proliferation •smoothened signaling pathway involved in spinal cord motor neuron cell fate specification •layer formation in cerebral cortex •embryonic morphogenesis •artery development •cell differentiation involved in kidney development •регуляція диференціювання клітин •forebrain development •neuron fate commitment •hippocampus development •camera-type eye morphogenesis •anterior/posterior pattern specification •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •prostate gland development •liver regeneration
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2737


14634

Ensembl


ENSG00000106571


ENSMUSG00000021318

UniProt


P10071


Q61602

RefSeq (мРНК)


NM_000168


NM_008130

RefSeq (білок)


NP_000159


NP_032156

Локус (UCSC)

Хр. 7: 41.96 – 42.26 Mb

Хр. 13: 15.64 – 15.9 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GLI3 (англ.GLI family zinc finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 580амінокислот, амолекулярна маса — 169 863^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAQSHSSTT	TEKKKVENSI	VKCSTRTDVS	EKAVASSTTS	NEDESPGQTY
HRERRNAITM	QPQNVQGLSK	VSEEPSTSSD	ERASLIKKEI	HGSLPHVAEP
SVPYRGTVFA	MDPRNGYMEP	HYHPPHLFPA	FHPPVPIDAR	HHEGRYHYDP
SPIPPLHMTS	ALSSSPTYPD	LPFIRISPHR	NPTAASESPF	SPPHPYINPY
MDYIRSLHSS	PSLSMISATR	GLSPTDAPHA	GVSPAEYYHQ	MALLTGQRSP
YADIIPSAAT	AGTGAIHMEY	LHAMDSTRFS	SPRLSARPSR	KRTLSISPLS
DHSFDLQTMI	RTSPNSLVTI	LNNSRSSSSA	SGSYGHLSAS	AISPALSFTY
SSAPVSLHMH	QQILSRQQSL	GSAFGHSPPL	IHPAPTFPTQ	RPIPGIPTVL
NPVQVSSGPS	ESSQNKPTSE	SAVSSTGDPM	HNKRSKIKPD	EDLPSPGARG
QQEQPEGTTL	VKEEGDKDES	KQEPEVIYET	NCHWEGCARE	FDTQEQLVHH
INNDHIHGEK	KEFVCRWLDC	SREQKPFKAQ	YMLVVHMRRH	TGEKPHKCTF
EGCTKAYSRL	ENLKTHLRSH	TGEKPYVCEH	EGCNKAFSNA	SDRAKHQNRT
HSNEKPYVCK	IPGCTKRYTD	PSSLRKHVKT	VHGPEAHVTK	KQRGDIHPRP
PPPRDSGSHS	QSRSPGRPTQ	GALGEQQDLS	NTTSKREECL	QVKTVKAEKP
MTSQPSPGGQ	SSCSSQQSPI	SNYSNSGLEL	PLTDGGSIGD	LSAIDETPIM
DSTISTATTA	LALQARRNPA	GTKWMEHVKL	ERLKQVNGMF	PRLNPILPPK
APAVSPLIGN	GTQSNNTCSL	GGPMTLLPGR	SDLSGVDVTM	LNMLNRRDSS
ASTISSAYLS	SRRSSGISPC	FSSRRSSEAS	QAEGRPQNVS	VADSYDPIST
DASRRSSEAS	QSDGLPSLLS	LTPAQQYRLK	AKYAAATGGP	PPTPLPNMER
MSLKTRLALL	GDALEPGVAL	PPVHAPRRCS	DGGAHGYGRR	HLQPHDAPGH
GVRRASDPVR	TGSEGLALPR	VPRFSSLSSC	NPPAMATSAE	KRSLVLQNYT
RPEGGQSRNF	HSSPCPPSIT	ENVTLESLTM	DADANLNDED	FLPDDVVQYL
NSQNQAGYEQ	HFPSALPDDS	KVPHGPGDFD	APGLPDSHAG	QQFHALEQPC
PEGSKTDLPI	QWNEVSSGSA	DLSSSKLKCG	PRPAVPQTRA	FGFCNGMVVH
PQNPLRSGPA	GGYQTLGENS	NPYGGPEHLM	LHNSPGSGTS	GNAFHEQPCK
APQYGNCLNR	QPVAPGALDG	ACGAGIQASK	LKSTPMQGSG	GQLNFGLPVA
PNESAGSMVN	GMQNQDPVGQ	GYLAHQLLGD	SMQHPGAGRP	GQQMLGQISA
TSHINIYQGP	ESCLPGAHGM	GSQPSSLAVV	RGYQPCASFG	GSRRQAMPRD
SLALQSGQLS	DTSQTCRVNG	IKMEMKGQPH	PLCSNLQNYS	GQFYDQTVGF
SQQDTKAGSF	SISDASCLLQ	GTSAKNSELL	SPGANQVTST	VDSLDSHDLE
GVQIDFDAII	DDGDHSSLMS	GALSPSIIQN	LSHSSSRLTT	PRASLPFPAL
SMSTTNMAIG	DMSSLLTSLA	EESKFLAVMQ

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів,активаторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі, клітинних відростках,війках.

Література

[ред. |ред. код]

Ruppert J.M., Vogelstein B., Arheden K., Kinzler K.W. (1990).GLI3 encodes a 190-kilodalton protein with multiple regions of GLI similarity.Mol. Cell. Biol.10: 5408—5415.PMID 2118997doi:10.1128/MCB.10.10.5408
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Wang B., Fallon J.F., Beachy P.A. (2000). Hedgehog-regulated processing of Gli3 produces an anterior/posterior repressor gradient in the developing vertebrate limb.Cell.100: 423—434.PMID 10693759doi:10.1016/S0092-8674(00)80678-9
Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins.J. Biol. Chem.276: 6889—6892.PMID 11238441doi:10.1074/jbc.C000773200
Tempe D., Casas M., Karaz S., Blanchet-Tournier M.F., Concordet J.P. (2006).Multisite protein kinase A and glycogen synthase kinase 3beta phosphorylation leads to Gli3 ubiquitination by SCFbetaTrCP.Mol. Cell. Biol.26: 4316—4326.PMID 16705181doi:10.1128/MCB.02183-05
Wang B., Li Y. (2006). Evidence for the direct involvement of {beta}TrCP in Gli3 protein processing.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.103: 33—38.PMID 16371461doi:10.1073/pnas.0509927103

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з GLI3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4319 (англ.) . Архіворигіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.[Архівовано 2017-08-22 уWayback Machine.]
↑UniProt, P10071 (англ.) . Архіворигіналу за 18 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 7

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR^[en] α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=GLI3&oldid=43998863

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭