GATA5 Ідентифікатори Символи GATA5 Зовнішні ІД OMIM :611496 MGI: 109497 HomoloGene: 32031 GeneCards: GATA5 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • zinc ion binding • chromatin binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to BMP stimulus • зсідання крові • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • intestinal epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • aortic valve morphogenesis • endocardial cushion fusion • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction • positive regulation of cardiac endothelial to mesenchymal transition • development of the heart • animal organ morphogenesis • гістогенез • розвиток клітин • anatomical structure formation involved in morphogenesis • digestive tract development • cardiac muscle tissue development • circulatory system development
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 20: 62.46 – 62.48 Mb Хр. 2: 179.97 – 179.98 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
GATA5 (англ. GATA binding protein 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 41 299[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MYQSLALAAS PRQAAYADSG SFLHAPGAGS PMFVPPARVP SMLSYLSGCE PSPQPPELAA RPGWAQTATA DSSAFGPGSP HPPAAHPPGA TAFPFAHSPS GPGSGGSAGG RDGSAYQGAL LPREQFAAPL GRPVGTSYSA TYPAYVSPDV AQSWTAGPFD GSVLHGLPGR RPTFVSDFLE EFPGEGRECV NCGALSTPLW RRDGTGHYLC NACGLYHKMN GVNRPLVRPQ KRLSSSRRAG LCCTNCHTTN TTLWRRNSEG EPVCNACGLY MKLHGVPRPL AMKKESIQTR KRKPKTIAKA RGSSGSTRNA SASPSAVAST DSSAATSKAK PSLASPVCPG PSMAPQASGQ EDDSLAPGHL EFKFEPEDFA FPSTAPSPQA GLRGALRQEA WCALALA
Кодований геном білок за функцією належить доактиваторів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Gu J.Y., Xu J.H., Yu H., Yang Y.Q. (2012). Novel GATA5 loss-of-function mutations underlie familial atrial fibrillation.Clinics (Sao Paulo) .67 : 1393—1399. PMID 23295592 doi :10.6061/clinics/2012(12)08 Padang R., Bagnall R.D., Richmond D.R., Bannon P.G., Semsarian C. (2012). Rare non-synonymous variations in the transcriptional activation domains of GATA5 in bicuspid aortic valve disease.J. Mol. Cell. Cardiol .53 : 277—281. PMID 22641149 doi :10.1016/j.yjmcc.2012.05.009 Huang R.T., Xue S., Xu Y.J., Zhou M., Yang Y.Q. (2014). Somatic GATA5 mutations in sporadic tetralogy of Fallot.Int. J. Mol. Med .33 : 1227—1235. PMID 24573614 doi :10.3892/ijmm.2014.1674
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
