Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

GATA2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

GATA2

Ідентифікатори

Символи

GATA2, DCML, IMD21, MONOMAC, NFE1B, GATA binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM:137295 MGI:95662 HomoloGene:32030 GeneCards:GATA2

Пов'язані генетичні захворювання

MonoMAC,Emberger syndrome,мієлодиспластичний синдром,гострий мієлоїдний лейкоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •DNA binding •sequence-specific DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •zinc ion binding •transcription factor binding •chromatin binding •C2H2 zinc finger domain binding •зв'язування з іоном металу •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•transcription regulator complex •нуклеоплазма •клітинне ядро •цитоплазма •GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	•commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain •positive regulation of phagocytosis •диференціація клітин •negative regulation of fat cell differentiation •pituitary gland development •positive regulation of phagocytosis, engulfment •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of erythrocyte differentiation •somatic stem cell population maintenance •negative regulation of macrophage differentiation •GABAergic neuron differentiation •positive regulation of cytosolic calcium ion concentration •negative regulation of fat cell proliferation •negative regulation of neural precursor cell proliferation •embryonic placenta development •neuron migration •зсідання крові •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •cell maturation •semicircular canal development •transcription, DNA-templated •regulation of primitive erythrocyte differentiation •ventral spinal cord interneuron differentiation •response to lipid •cell differentiation in hindbrain •central nervous system neuron development •inner ear morphogenesis •positive regulation of neuron differentiation •regulation of histone acetylation •neuron differentiation •regulation of forebrain neuron differentiation •Фагоцитоз •urogenital system development •Детермінація •homeostasis of number of cells within a tissue •definitive hemopoiesis •neuron fate commitment •negative regulation of myeloid cell differentiation •positive regulation of megakaryocyte differentiation •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of Notch signaling pathway •eosinophil fate commitment •positive regulation of mast cell degranulation •cochlea development •regulation of hematopoietic stem cell differentiation •positive regulation of angiogenesis •negative regulation of endothelial cell apoptotic process •GO:1901313 positive regulation of gene expression •negative regulation of gene expression •кровотворення •pri-miRNA transcription by RNA polymerase II •positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis •positive regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis •heart development •animal organ morphogenesis •гістогенез •розвиток клітин •anatomical structure formation involved in morphogenesis •positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II •digestive tract development
Джерела:Amigo /QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2624


14461

Ensembl


ENSG00000179348


ENSMUSG00000015053

UniProt


P23769


O09100

RefSeq (мРНК)


NM_032638 NM_001145661 NM_001145662


NM_008090 NM_001355253

RefSeq (білок)


NP_001139133 NP_001139134 NP_116027


NP_032116 NP_001342182

Локус (UCSC)

Хр. 3: 128.48 – 128.49 Mb

Хр. 6: 88.17 – 88.18 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GATA2 (англ.GATA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480амінокислот, амолекулярна маса — 50 500^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVAPEQPRW	MAHPAVLNAQ	HPDSHHPGLA	HNYMEPAQLL	PPDEVDVFFN
HLDSQGNPYY	ANPAHARARV	SYSPAHARLT	GGQMCRPHLL	HSPGLPWLDG
GKAALSAAAA	HHHNPWTVSP	FSKTPLHPSA	AGGPGGPLSV	YPGAGGGSGG
GSGSSVASLT	PTAAHSGSHL	FGFPPTPPKE	VSPDPSTTGA	ASPASSSAGG
SAARGEDKDG	VKYQVSLTES	MKMESGSPLR	PGLATMGTQP	ATHHPIPTYP
SYVPAAAHDY	SSGLFHPGGF	LGGPASSFTP	KQRSKARSCS	EGRECVNCGA
TATPLWRRDG	TGHYLCNACG	LYHKMNGQNR	PLIKPKRRLS	AARRAGTCCA
NCQTTTTTLW	RRNANGDPVC	NACGLYYKLH	NVNRPLTMKK	EGIQTRNRKM
SNKSKKSKKG	AECFEELSKC	MQEKSSPFSA	AALAGHMAPV	GHLPPFSHSG
HILPTPTPIH	PSSSLSFGHP	HPSSMVTAMG

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції, поліморфізм,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Lee M.-E., Temizer D.T., Clifford J.A., Quertermous T. (1991). Cloning of the GATA-binding protein that regulates endothelin-1 gene expression in endothelial cells.J. Biol. Chem.266: 16188—16192.PMID 1714909
Dorfman D.M., Wilson D.B., Bruns G.A.P., Orkin S.H. (1992). Human transcription factor GATA-2. Evidence for regulation of preproendothelin-1 gene expression in endothelial cells.J. Biol. Chem.267: 1279—1285.PMID 1370462

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з GATA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4171 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P23769 (англ.) . Архіворигіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 3

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR^[en] α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=GATA2&oldid=43427071

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭