Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

FOXM1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

FOXM1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
3G73

Ідентифікатори

Символи

FOXM1, FKHL16, FOXM1B, HFH-11, HFH11, HNF-3, INS-1, MPHOSPH2, MPP-2, MPP2, PIG29, TGT3, TRIDENT, forkhead box M1, FOXM1A, FOXM1C

Зовнішні ІД

OMIM:602341 MGI:1347487 HomoloGene:7318 GeneCards:FOXM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •sequence-specific DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein kinase binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•клітинне ядро •нуклеоплазма
Біологічний процес	•positive regulation of double-strand break repair •regulation of Ras protein signal transduction •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process •transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •regulation of cell cycle •cellular response to DNA damage stimulus •regulation of cell population proliferation •G2/M transition of mitotic cell cycle •regulation of cell growth •positive regulation of cell population proliferation •negative regulation of stress-activated MAPK cascade •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •GO:0100026 Репарація ДНК •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •anatomical structure morphogenesis •диференціація клітин •клітинний цикл •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2305


14235

Ensembl


ENSG00000111206


ENSMUSG00000001517

UniProt


Q08050


O08696

RefSeq (мРНК)


NM_001243088 NM_001243089 NM_021953 NM_202002 NM_202003


NM_008021

RefSeq (білок)


NP_001230017 NP_001230018 NP_068772 NP_973731 NP_973732


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 12: 2.86 – 2.88 Mb

Хр. 6: 128.34 – 128.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FOXM1 (англ.Forkhead box M1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 763амінокислот, амолекулярна маса — 84 283^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKTSPRRPLI	LKRRRLPLPV	QNAPSETSEE	EPKRSPAQQE	SNQAEASKEV
AESNSCKFPA	GIKIINHPTM	PNTQVVAIPN	NANIHSIITA	LTAKGKESGS
SGPNKFILIS	CGGAPTQPPG	LRPQTQTSYD	AKRTEVTLET	LGPKPAARDV
NLPRPPGALC	EQKRETCADG	EAAGCTINNS	LSNIQWLRKM	SSDGLGSRSI
KQEMEEKENC	HLEQRQVKVE	EPSRPSASWQ	NSVSERPPYS	YMAMIQFAIN
STERKRMTLK	DIYTWIEDHF	PYFKHIAKPG	WKNSIRHNLS	LHDMFVRETS
ANGKVSFWTI	HPSANRYLTL	DQVFKPLDPG	SPQLPEHLES	QQKRPNPELR
RNMTIKTELP	LGARRKMKPL	LPRVSSYLVP	IQFPVNQSLV	LQPSVKVPLP
LAASLMSSEL	ARHSKRVRIA	PKVLLAEEGI	APLSSAGPGK	EEKLLFGEGF
SPLLPVQTIK	EEEIQPGEEM	PHLARPIKVE	SPPLEEWPSP	APSFKEESSH
SWEDSSQSPT	PRPKKSYSGL	RSPTRCVSEM	LVIQHRERRE	RSRSRRKQHL
LPPCVDEPEL	LFSEGPSTSR	WAAELPFPAD	SSDPASQLSY	SQEVGGPFKT
PIKETLPISS	TPSKSVLPRT	PESWRLTPPA	KVGGLDFSPV	QTSQGASDPL
PDPLGLMDLS	TTPLQSAPPL	ESPQRLLSSE	PLDLISVPFG	NSSPSDIDVP
KPGSPEPQVS	GLAANRSLTE	GLVLDTMNDS	LSKILLDISF	PGLDEDPLGP
DNINWSQFIP	ELQ

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,клітинний цикл, пошкодження ДНК,репарація ДНК,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Yao K.-M., Sha M., Lu Z., Wong G.G. (1997).Molecular analysis of a novel winged helix protein, WIN. Expression pattern, DNA binding property, and alternative splicing within the DNA binding domain.J. Biol. Chem.272: 19827—19836.PMID 9242644doi:10.1074/jbc.272.32.19827
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Westendorf J.M., Rao P.N., Gerace L. (1994). Cloning of cDNAs for M-phase phosphoproteins recognized by the MPM2 monoclonal antibody and determination of the phosphorylated epitope.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.91: 714—718.PMID 8290587doi:10.1073/pnas.91.2.714
Tan Y., Raychaudhuri P., Costa R.H. (2007).Chk2 mediates stabilization of the FoxM1 transcription factor to stimulate expression of DNA repair genes.Mol. Cell. Biol.27: 1007—1016.PMID 17101782doi:10.1128/MCB.01068-06
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.Cell Rep.10: 1778—1791.PMID 25772364doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3818 (англ.) . Архіворигіналу за 2 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.[Архівовано 2017-08-02 уWayback Machine.]
↑UniProt, Q08050 (англ.) . Архіворигіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 12

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=FOXM1&oldid=46706057

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭