FOXK2 Ідентифікатори Символи FOXK2 Зовнішні ІД OMIM :147685 MGI: 1916087 HomoloGene: 18748 GeneCards: FOXK2 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма
Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular glucose homeostasis • negative regulation of autophagy • regulation of glucose metabolic process • response to starvation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • canonical glycolysis
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 17: 82.52 – 82.64 Mb Хр. 11: 121.26 – 121.31 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
FOXK2 (англ. Forkhead box K2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 69 062[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MAAAAAALSG AGTPPAGGGA GGGGAGGGGS PPGGWAVARL EGREFEYLMK KRSVTIGRNS SQGSVDVSMG HSSFISRRHL EIFTPPGGGG HGGAAPELPP AQPRPDAGGD FYLRCLGKNG VFVDGVFQRR GAPPLQLPRV CTFRFPSTNI KITFTALSSE KREKQEASES PVKAVQPHIS PLTINIPDTM AHLISPLPSP TGTISAANSC PSSPRGAGSS GYKVGRVMPS DLNLMADNSQ PENEKEASGG DSPKDDSKPP YSYAQLIVQA ITMAPDKQLT LNGIYTHITK NYPYYRTADK GWQNSIRHNL SLNRYFIKVP RSQEEPGKGS FWRIDPASES KLIEQAFRKR RPRGVPCFRT PLGPLSSRSA PASPNHAGVL SAHSSGAQTP ESLSREGSPA PLEPEPGAAQ PKLAVIQEAR FAQSAPGSPL SSQPVLITVQ RQLPQAIKPV TYTVATPVTT STSQPPVVQT VHVVHQIPAV SVTSVAGLAP ANTYTVSGQA VVTPAAVLAP PKAEAQENGD HREVKVKVEP IPAIGHATLG TASRIIQTAQ TTPVQTVTIV QQAPLGQHQL PIKTVTQNGT HVASVPTAVH GQVNNAAASP LHMLATHASA SASLPTKRHN GDQPEQPELK RIKTEDGEGI VIALSVDTPP AAVREKGVQN
Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,ацетилювання ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів,ДНК , іономмагнію . Локалізований уядрі .
Li C., Lai C., Sigman D.S., Gaynor R.B. (1991). Cloning of a cellular factor, interleukin binding factor, that binds to NFAT-like motifs in the human immunodeficiency virus long terminal repeat.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .88 : 7739—7743. PMID 1909027 doi :10.1073/pnas.88.17.7739 Li C., Lusis A.J., Sparkes R., Nirula A., Gaynor R.B. (1992). Characterization and chromosomal mapping of the gene encoding the cellular DNA binding protein ILF.Genomics .13 : 665—671. PMID 1339390 doi :10.1016/0888-7543(92)90139-J
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
