FOXD4 Ідентифікатори Символи FOXD4 Зовнішні ІД OMIM :601092 MGI: 1347467 HomoloGene: 83248 GeneCards: FOXD4 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • DNA binding, bending • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 9: 0.12 – 0.12 Mb Хр. 19: 24.88 – 24.88 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
FOXD4 (англ. Forkhead box D4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 47 309[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MNLPRAERLR STPQRSLRDS DGEDGKIDVL GEEEDEDEEE AASQQFLEQS LQPGLQVARW GGVALPREHI EGGGGPSDPS EFGTEFRAPP RSAAASEDAR QPAKPPSSYI ALITMAILQS PHKRLTLSGI CAFISDRFPY YRRKFPAWQN SIRHNLSLND CFVKIPREPG RPGKGNYWSL DPASQDMFDN GSFLRRRKRF QRHQPTPGAH LPHPFPLPAA HAALHNPRPG PLLGAPAPPQ PVPGAYPNTG PGRRPYALLH PHPPRYLLLS APAYAGAPKK AEGADLATPA PFPCCSPHLV LSLGRRARVW RRHREADASL SALRVSCKGS GERVQGLRRV CPRPRGATAP CSSDRQACRT ILQQQQRHQE EDCANGCAPT KGAVLGGHLS AASALLRYQA VAEGSGLTSL AAPLGGEGTS PVFLVSPTPS SLAESAGPS
Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Freyaldenhoven B.S., Fried C., Wielckens K. (2002). FOXD4a and FOXD4b, two new winged helix transcription factors, are expressed in human leukemia cell lines.Gene .294 : 131—140. PMID 12234674 doi :10.1016/S0378-1119(02)00702-3 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res. 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Fan Y., Newman T., Linardopoulou E., Trask B.J. (2002). Gene content and function of the ancestral chromosome fusion site in human chromosome 2q13-2q14.1 and paralogous regions.Genome Res. 12 : 1663—1672. PMID 12421752 doi :10.1101/gr.338402 Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994).Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending .EMBO J .13 : 5002—5012. PMID 7957066
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
