FOXC2 Ідентифікатори Символи FOXC2 Зовнішні ІД OMIM :602402 MGI: 1347481 HomoloGene: 21091 GeneCards: FOXC2 Пов'язані генетичні захворювання Lymphedema–distichiasis syndrome [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin DNA binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • somitogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system development • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • neural crest cell development • paraxial mesoderm formation • paraxial mesodermal cell fate commitment • осифікація • lymphangiogenesis • collagen fibril organization • розвиток нирки • glomerular mesangial cell development • heart morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cardiac muscle cell proliferation • lymph vessel development • transcription, DNA-templated • embryonic heart tube development • positive regulation of endothelial cell migration • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • development of the heart • blood vessel remodeling • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • blood vessel development • positive regulation of vascular wound healing • artery morphogenesis • branching involved in blood vessel morphogenesis • glomerular visceral epithelial cell differentiation • response to hormone • embryonic viscerocranium morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • camera-type eye development • glomerular endothelium development • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • mesoderm development • regulation of organ growth • metanephros development • проліферація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process involved in outflow tract morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • negative regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 16: 86.57 – 86.57 Mb Хр. 8: 121.84 – 121.85 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
FOXC2 (англ. Forkhead box C2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 53 719[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MQARYSVSDP NALGVVPYLS EQNYYRAAGS YGGMASPMGV YSGHPEQYSA GMGRSYAPYH HHQPAAPKDL VKPPYSYIAL ITMAIQNAPE KKITLNGIYQ FIMDRFPFYR ENKQGWQNSI RHNLSLNECF VKVPRDDKKP GKGSYWTLDP DSYNMFENGS FLRRRRRFKK KDVSKEKEER AHLKEPPPAA SKGAPATPHL ADAPKEAEKK VVIKSEAASP ALPVITKVET LSPESALQGS PRSAASTPAG SPDGSLPEHH AAAPNGLPGF SVENIMTLRT SPPGGELSPG AGRAGLVVPP LALPYAAAPP AAYGQPCAQG LEAGAAGGYQ CSMRAMSLYT GAERPAHMCV PPALDEALSD HPSGPTSPLS ALNLAAGQEG ALAATGHHHQ HHGHHHPQAP PPPPAPQPQP TPQPGAAAAQ AASWYLNHSG DLNHLPGHTF AAQQQTFPNV REMFNSHRLG IENSTLGESQ VSGNASCQLP YRSTPPLYRH AAPYSYDCTK Y
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,білків розвитку ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Miura N., Iida K., Kakinuma H., Yang X.-L., Sugiyama T. (1997). Isolation of the mouse (MFH-1) and human (FKHL 14) mesenchyme fork head-1 genes reveals conservation of their gene and protein structures.Genomics .41 : 489—492. PMID 9169153 doi :10.1006/geno.1997.4695 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 van Dongen M.J., Cederberg A., Carlsson P., Enerback S., Wikstrom M. (2000). Solution structure and dynamics of the DNA-binding domain of the adipocyte-transcription factor FREAC-11.J. Mol. Biol .296 : 351—359. PMID 10669593 doi :10.1006/jmbi.1999.3476
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
