Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

FOXA2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

FOXA2

Ідентифікатори

Символи

FOXA2, HNF3B, TCF3B, forkhead box A2, HNF-3-beta

Зовнішні ІД

OMIM:600288 MGI:1347476 HomoloGene:7762 GeneCards:FOXA2

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •sequence-specific DNA binding •protein domain specific binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •transcription factor binding •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •нуклеоплазма •міжклітинні контакти •клітинне ядро
Біологічний процес	•dopaminergic neuron differentiation •regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of gastrulation •response to interleukin-6 •positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •cell fate specification •adult locomotory behavior •negative regulation of DNA-binding transcription factor activity •transcription, DNA-templated •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •multicellular organism development •negative regulation of glucokinase activity •negative regulation of detection of glucose •regulation of blood coagulation •positive regulation of embryonic development •primitive streak formation •negative regulation of epithelial to mesenchymal transition •endocrine pancreas development •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin •anatomical structure morphogenesis •GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization •negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose •диференціація клітин
Джерела:Amigo /QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3170


15376

Ensembl


ENSG00000125798


ENSMUSG00000037025

UniProt


Q9Y261


P35583

RefSeq (мРНК)


NM_021784 NM_153675


NM_001291065 NM_001291067 NM_010446

RefSeq (білок)


NP_068556 NP_710141


NP_001277994 NP_001277996 NP_034576

Локус (UCSC)

Хр. 20: 22.58 – 22.59 Mb

Хр. 2: 147.88 – 147.89 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FOXA2 (англ.Forkhead box A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457амінокислот, амолекулярна маса — 48 306^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLGAVKMEGH	EPSDWSSYYA	EPEGYSSVSN	MNAGLGMNGM	NTYMSMSAAA
MGSGSGNMSA	GSMNMSSYVG	AGMSPSLAGM	SPGAGAMAGM	GGSAGAAGVA
GMGPHLSPSL	SPLGGQAAGA	MGGLAPYANM	NSMSPMYGQA	GLSRARDPKT
YRRSYTHAKP	PYSYISLITM	AIQQSPNKML	TLSEIYQWIM	DLFPFYRQNQ
QRWQNSIRHS	LSFNDCFLKV	PRSPDKPGKG	SFWTLHPDSG	NMFENGCYLR
RQKRFKCEKQ	LALKEAAGAA	GSGKKAAAGA	QASQAQLGEA	AGPASETPAG
TESPHSSASP	CQEHKRGGLG	ELKGTPAAAL	SPPEPAPSPG	QQQQAAAHLL
GPPHHPGLPP	EAHLKPEHHY	AFNHPFSINN	LMSSEQQHHH	SHHHHQPHKM
DLKAYEQVMH	YPGYGSPMPG	SLAMGPVTNK	TGLDASPLAA	DTSYYQGVYS
RPIMNSS

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,регуляторів хроматину,білків розвитку,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Wolfrum C., Besser D., Luca E., Stoffel M. (2003). Insulin regulates the activity of forkhead transcription factor Hnf-3beta/Foxa-2 by Akt-mediated phosphorylation and nuclear/cytosolic localization.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.100: 11624—11629.PMID 14500912doi:10.1073/pnas.1931483100
Verschuur M., de Jong M., Felida L., de Maat M.P., Vos H.L. (2005).A hepatocyte nuclear factor-3 site in the fibrinogen beta promoter is important for interleukin 6-induced expression, and its activity is influenced by the adjacent -148C/T polymorphism.J. Biol. Chem.280: 16763—16771.PMID 15737987doi:10.1074/jbc.M501973200

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5022 (англ.) . Архіворигіналу за 26 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.[Архівовано 2017-05-26 уWayback Machine.]
↑UniProt, Q9Y261 (англ.) . Архіворигіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 20

Посилання

[ред. |ред. код]

NAUKA.UA (27 грудня 2024).Біологи перетворили клітини раку кишківника на здорові.nauka.ua(укр.). Процитовано 9 січня 2025.

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=FOXA2&oldid=46705873

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭