ETV4 Ідентифікатори Символи ETV4 , E1A-F, E1AF, PEA3, PEAS3, ETS variant 4, ETS variant transcription factor 4Зовнішні ІД OMIM :600711 MGI: 99423 HomoloGene: 1504 GeneCards: ETV4 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 17: 43.53 – 43.58 Mb Хр. 11: 101.66 – 101.68 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ETV4 (англ. ETS variant 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484амінокислот , амолекулярна маса — 53 938[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MERRMKAGYL DQQVPYTFSS KSPGNGSLRE ALIGPLGKLM DPGSLPPLDS EDLFQDLSHF QETWLAEAQV PDSDEQFVPD FHSENLAFHS PTTRIKKEPQ SPRTDPALSC SRKPPLPYHH GEQCLYSSAY DPPRQIAIKS PAPGALGQSP LQPFPRAEQR NFLRSSGTSQ PHPGHGYLGE HSSVFQQPLD ICHSFTSQGG GREPLPAPYQ HQLSEPCPPY PQQSFKQEYH DPLYEQAGQP AVDQGGVNGH RYPGAGVVIK QEQTDFAYDS DVTGCASMYL HTEGFSGPSP GDGAMGYGYE KPLRPFPDDV CVVPEKFEGD IKQEGVGAFR EGPPYQRRGA LQLWQFLVAL LDDPTNAHFI AWTGRGMEFK LIEPEEVARL WGIQKNRPAM NYDKLSRSLR YYYEKGIMQK VAGERYVYKF VCEPEALFSL AFPDNQRPAL KAEFDRPVSE EDTVPLSHLD ESPAYLPELA GPAQPFGPKG GYSY
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Coutte L., Monte D., Baert J.-L., de Launoit Y. (1999). Genomic organization of the human e1af gene, a member of Ets transcription factors.Gene .240 : 201—207. PMID 10564827 doi :10.1016/S0378-1119(99)00400-X The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Higashino F., Yoshida K., Fujinaga K., Kamio K., Fujinaga K. (1993). Isolation of a cDNA encoding the adenovirus E1A enhancer binding protein: a new human member of the ets oncogene family.Nucleic Acids Res .21 : 547—553. PMID 8441666 doi :10.1093/nar/21.3.547 Guo B., Sharrocks A.D. (2009).Extracellular signal-regulated kinase mitogen-activated protein kinase signaling initiates a dynamic interplay between sumoylation and ubiquitination to regulate the activity of the transcriptional activator PEA3 .Mol. Cell. Biol .29 : 3204—3218. PMID 19307308 doi :10.1128/MCB.01128-08
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші