Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

ESR2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

ESR2

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
4J26,1L2J,1NDE,1QKM,1U3Q,1U3R,1U3S,1U9E,1X76,1X78,1X7B,1X7J,1YY4,1YYE,1ZAF,2FSZ,2GIU,2I0G,2JJ3,2NV7,2QTU,2YJD,2YLY,2Z4B,3OLL,3OLS,3OMO,3OMP,3OMQ,4J24,4ZI1

Ідентифікатори

Символи

ESR2, ER-BETA, ESR-BETA, ESRB, ESTRB, Erb, NR3A2, estrogen receptor 2, ODG8

Зовнішні ІД

OMIM:601663 MGI:109392 HomoloGene:1100 GeneCards:ESR2

Реагує на сполуку

Естрадіол,діетилстільбестрол,estriol,estrone,ethinylestradiol,Геністейн,тамоксифен,бісфенол А,lasofoxifene,bazedoxifene,C₂₈H₂₇NO₄S,fosfestrol,acolbifene,erteberel,estramustine phosphate sodium,droloxifene^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity •зв’язування з іоном металу •steroid hormone receptor activity •steroid binding •zinc ion binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •DNA binding •sequence-specific DNA binding •GO:0001105 transcription coactivator activity •receptor antagonist activity •lipid binding •enzyme binding •estrogen response element binding •core promoter sequence-specific DNA binding •estrogen receptor activity •identical protein binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	•мітохондрія •клітинне ядро •нуклеоплазма •extracellular region
Біологічний процес	•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •transcription, DNA-templated •negative regulation of cell growth •transcription initiation from RNA polymerase II promoter •positive regulation of DNA-binding transcription factor activity •cell-cell signaling •GO:0072468 сигнальна трансдукція •extracellular negative regulation of signal transduction •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •intracellular estrogen receptor signaling pathway •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •cellular response to estradiol stimulus •negative regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2100


13983

Ensembl


ENSG00000140009


ENSMUSG00000021055

UniProt


Q92731


O08537

RefSeq (мРНК)

NM_001040275 NM_001040276 NM_001214902 NM_001214903 NM_001271876
NM_001271877 NM_001291712 NM_001291723 NM_001437


NM_010157 NM_207707

RefSeq (білок)

NP_001035365 NP_001201831 NP_001258805 NP_001258806 NP_001278641
NP_001278652 NP_001428


NP_034287 NP_997590

Локус (UCSC)

Хр. 14: 64.08 – 64.34 Mb

Хр. 12: 76.17 – 76.22 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ESR2 (англ.Estrogen receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530амінокислот, амолекулярна маса — 59 216^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDIKNSPSSL	NSPSSYNCSQ	SILPLEHGSI	YIPSSYVDSH	HEYPAMTFYS
PAVMNYSIPS	NVTNLEGGPG	RQTTSPNVLW	PTPGHLSPLV	VHRQLSHLYA
EPQKSPWCEA	RSLEHTLPVN	RETLKRKVSG	NRCASPVTGP	GSKRDAHFCA
VCSDYASGYH	YGVWSCEGCK	AFFKRSIQGH	NDYICPATNQ	CTIDKNRRKS
CQACRLRKCY	EVGMVKCGSR	RERCGYRLVR	RQRSADEQLH	CAGKAKRSGG
HAPRVRELLL	DALSPEQLVL	TLLEAEPPHV	LISRPSAPFT	EASMMMSLTK
LADKELVHMI	SWAKKIPGFV	ELSLFDQVRL	LESCWMEVLM	MGLMWRSIDH
PGKLIFAPDL	VLDRDEGKCV	EGILEIFDML	LATTSRFREL	KLQHKEYLCV
KAMILLNSSM	YPLVTATQDA	DSSRKLAHLL	NAVTDALVWV	IAKSGISSQQ
QSMRLANLLM	LLSHVRHASN	KGMEHLLNMK	CKNVVPVYDL	LLEMLNAHVL
RGCKSSITGS	ECSPAEDSKS	KEGSQNPQSQ

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дорецепторів,активаторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зліпідами, іонами металів, іономцинку,ДНК,стероїдами. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Lee, E.B.; Chakravarthi, V.P.; Wolfe, M.W.; Rumi, M.A.K. ERβ Regulation of Gonadotropin Responses during Folliculogenesis.Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 10348.https://doi.org/10.3390/ijms221910348(англ.)
Leung Y.K., Mak P., Hassan S., Ho S.M. (2006). Estrogen receptor (ER)-beta isoforms: a key to understanding ER-beta signaling.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.103: 13162—13167.PMID 16938840doi:10.1073/pnas.0605676103
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Li L.C., Yeh C.C., Nojima D., Dahiya R. (2000). Cloning and characterization of human estrogen receptor beta promoter.Biochem. Biophys. Res. Commun.275: 682—689.PMID 10964723doi:10.1006/bbrc.2000.3363
Mosselman S., Polman J., Dijkema R. (1996).ER beta: identification and characterization of a novel human estrogen receptor.FEBS Lett.392: 49—53.PMID 8769313doi:10.1016/0014-5793(96)00782-X
Pace P., Taylor J., Suntharalingam S., Coombes R.C., Ali S. (1997).Human estrogen receptor beta binds DNA in a manner similar to and dimerizes with estrogen receptor alpha.J. Biol. Chem.272: 25832—25838.PMID 9325313doi:10.1074/jbc.272.41.25832
Caira F., Antonson P., Pelto-Huikko M., Treuter E., Gustafsson J.-A. (2000).Cloning and characterization of RAP250, a nuclear receptor coactivator.J. Biol. Chem.275: 5308—5317.PMID 10681503doi:10.1074/jbc.275.8.5308

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Сполуки, які фізично взаємодіють з estrogen receptor 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3468 (англ.) . Архіворигіналу за 22 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.[Архівовано 2016-03-22 уWayback Machine.]
↑UniProt, Q92731 (англ.) . Архіворигіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 14

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=ESR2&oldid=46680653

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭