Movatterモバイル変換


[0]ホーム

URL:


Перейти до вмісту
Вікіпедія
Пошук

EPAS1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
EPAS1
Наявні структури
PDBПошук ортологів:PDBeRCSB
Список кодів PDB

1P97,2A24,3F1N,3F1O,3F1P,3H7W,3H82,4GHI,4GS9,4PKY,4XT2

Ідентифікатори
СимволиEPAS1, ECYT4, HIF2A, HLF, MOP2, PASD2, bHLHe73, endothelial PAS domain protein 1, Hypoxia-inducible factor-2alpha
Зовнішні ІДOMIM:603349MGI:109169HomoloGene:1095GeneCards:EPAS1
Пов'язані генетичні захворювання
Рак нирки[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
histone acetyltransferase binding
protein heterodimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
nuclear speck
transcription regulator complex
нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

surfactant homeostasis
диференціація клітин
response to hypoxia
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress
lung development
norepinephrine metabolic process
iron ion homeostasis
mitochondrion organization
embryonic placenta development
cell maturation
GO:0001306 response to oxidative stress
transcription, DNA-templated
регуляція серцевого ритму
multicellular organism development
blood vessel remodeling
myoblast fate commitment
Ангіогенез
regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
erythrocyte differentiation
GO:0072468 сигнальна трансдукція
зір
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to hypoxia
transcription by RNA polymerase II
посттрансляційна модифікація
кровотворення
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of cold-induced thermogenesis
Убіквітин-залежний протеоліз

Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії
Більше даних
Ортологи
ВидиЛюдинаМиша
Entrez
2034
13819
Ensembl
ENSG00000116016
ENSMUSG00000024140
UniProt
Q99814
P97481
RefSeq (мРНК)
NM_001430
NM_010137
RefSeq (білок)
NP_001421
NP_034267
Локус (UCSC)Хр. 2: 46.29 – 46.39 MbХр. 17: 87.06 – 87.14 Mb
PubMed search[2][3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EPAS1 (англ.Endothelial PAS domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870амінокислот, амолекулярна маса — 96 459[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTADKEKKRSSSERRKEKSRDAARCRRSKETEVFYELAHELPLPHSVSSH
LDKASIMRLAISFLRTHKLLSSVCSENESEAEADQQMDNLYLKALEGFIA
VVTQDGDMIFLSENISKFMGLTQVELTGHSIFDFTHPCDHEEIRENLSLK
NGSGFGKKSKDMSTERDFFMRMKCTVTNRGRTVNLKSATWKVLHCTGQVK
VYNNCPPHNSLCGYKEPLLSCLIIMCEPIQHPSHMDIPLDSKTFLSRHSM
DMKFTYCDDRITELIGYHPEELLGRSAYEFYHALDSENMTKSHQNLCTKG
QVVSGQYRMLAKHGGYVWLETQGTVIYNPRNLQPQCIMCVNYVLSEIEKN
DVVFSMDQTESLFKPHLMAMNSIFDSSGKGAVSEKSNFLFTKLKEEPEEL
AQLAPTPGDAIISLDFGNQNFEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSE
AGSLPAFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSSCSTPNSPEDYYTSLDNDLKIEV
IEKLFAMDTEAKDQCSTQTDFNELDLETLAPYIPMDGEDFQLSPICPEER
LLAENPQSTPQHCFSAMTNIFQPLAPVAPHSPFLLDKFQQQLESKKTEPE
HRPMSSIFFDAGSKASLPPCCGQASTPLSSMGGRSNTQWPPDPPLHFGPT
KWAVGDQRTEFLGAAPLGPPVSPPHVSTFKTRSAKGFGARGPDVLSPAMV
ALSNKLKLKRQLEYEEQAFQDLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPL
MPDKPLSANVPNDKFTQNPMRGLGHPLRHLPLPQPPSAISPGENSKSRFP
PQCYATQYQDYSLSSAHKVSGMASRLLGPSFESYLLPELTRYDCEVNVPV
LGSSTLLQGGDLLRALDQAT

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,білків розвитку,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції,ангіогенез, диференціація, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]
  • Tian H., McKnight S.L., Russell D.W. (1997). Endothelial PAS domain protein 1 (EPAS1), a transcription factor selectively expressed in endothelial cells.Genes Dev.11: 72—82.PMID 9000051doi:10.1101/gad.11.1.72
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. |ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з EPAS1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3374 (англ.) . Архіворигіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.[Архівовано 2015-10-17 уWayback Machine.]
  5. UniProt, Q99814 (англ.) . Архіворигіналу за 21 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]
Молекула міоглобінуЦе незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1)Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші
Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=EPAS1&oldid=43995108
Категорії:
Приховані категорії:

[8]ページ先頭

©2009-2025 Movatter.jp