EGR4 Ідентифікатори Символи EGR4 Зовнішні ІД OMIM :128992 MGI: 99252 HomoloGene: 1485 GeneCards: EGR4 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to growth factor stimulus
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 2: 73.29 – 73.29 Mb Хр. 6: 85.49 – 85.49 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
EGR4 (англ. Early growth response 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 61 623[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MAVARGVGSP EPAPPQLYKW GGCGLGEPGS ALERRGAAAR GRCGRARAPR LPDSFPRGEC PKPGARAPRS VRCGEPLPPA SPPPARPQAQ RARPRAPHSR RRAMLHLSEF SEPDALLVKS TEGCCAEPSA ELPRLPARDA PAATGYPGAG DFLSWALNSC GASGDLADSC FLEGPAPTPP PGLSYSGSFF IQAVPEHPHD PEALFNLMSG ILGLAPFPGP EAAASRSPLD APFPAGSDAL LPGPPDLYSP DLGAAPFPEA FWEASPCAGA PSQCLYEPQL SPPDVKPGLR APPASPALDA VSAFKGPYAP WELLSVGAPG NCGSQGDYQA APEARFPVIG TKIEDLLSIS CPAELPAVPA NRLYPSGAYD AFPLAPGDLG EGAEGLPGLL TPPSGEGGSS GDGGEFLAST QPQLSPLGLR SAAAADFPKP LVADIPGSSG VAAPPVPPPP PTPFPQAKAR RKGRRGGKCS TRCFCPRPHA KAFACPVESC VRSFARSDEL NRHLRIHTGH KPFQCRICLR NFSRSDHLTT HVRTHTGEKP FACDVCGRRF ARSDEKKRHS KVHLKQKARA EERLKGLGFY SLGLSFASL
Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уядрі .
Holst C., Skerka C., Lichter P., Bialonski A., Zipfel P.F. (1993). Genomic organization, chromosomal localization and promoter function of the human zinc-finger gene pAT133.Hum. Mol. Genet .2 : 367—372. PMID 8504297 doi :10.1093/hmg/2.4.367 Mueller H.-J., Skerka C., Bialonski A., Zipfel P.F. (1991). Clone pAT133 identifies a gene that encodes another human member of a class of growth factor-induced genes with almost identical zinc-finger domains.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .88 : 10079—10083. PMID 1658795 doi :10.1073/pnas.88.22.10079
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
