Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

E4F1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

E4F1

Ідентифікатори

Символи

E4F1, E4F, E4F transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM:603022 MGI:109530 HomoloGene:3259 GeneCards:E4F1

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001106 transcription corepressor activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001105 transcription coactivator activity •зв’язування з іоном металу •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •nucleic acid binding •cAMP response element binding •transferase activity •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •веретено поділу •нуклеоплазма •клітинне ядро
Біологічний процес	•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •поділ клітини •реплікація ДНК •regulation of mitotic cell cycle, embryonic •Убіквітин-залежний протеоліз •regulation of growth •клітинний цикл •проліферація •GO:0022415 viral process •regulation of cell cycle process •positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1877


13560

Ensembl


ENSG00000167967


ENSMUSG00000024137

UniProt


Q66K89


Q8CCE9

RefSeq (мРНК)


NM_001288776 NM_001288778 NM_004424


NM_001301784 NM_007893 NM_001355708

RefSeq (білок)


NP_001275705 NP_001275707 NP_004415


NP_001288713 NP_031919 NP_001342637

Локус (UCSC)

Хр. 16: 2.22 – 2.24 Mb

Хр. 17: 24.66 – 24.69 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

E4F1 (англ.E4F transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784амінокислот, амолекулярна маса — 83 496^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGAMAVRVT	AAHTAEAQAE	AGREAGEGAV	AAVAAALAPS	GFLGLPAPFS
EEDEDDVHRC	GRCQAEFTAL	EDFVQHKIQK	ACQRAPPEAL	PATPATTALL
GQEVVPAAPG	PEEPITVAHI	VVEAASLAAD	ISHASDLVGG	GHIKEVIVAA
EAELGDGEMA	EAPGSPRQQG	LGLAGEGEQA	QVKLLVNKDG	RYVCALCHKT
FKTGSILKAH	MVTHSSRKDH	ECKLCGASFR	TKGSLIRHHR	RHTDERPYKC
SKCGKSFRES	GALTRHLKSL	TPCTEKIRFS	VSKDVVVSKE	DARAGSGAGA
AGLGTATSSV	TGEPIETSPV	IHLVTDAKGT	VIHEVHVQMQ	ELSLGMKALA
PEPPVSQELP	CSSEGSRENL	LHQAMQNSGI	VLERAAGEEG	ALEPAPAAGS
SPQPLAVAAP	QLPVLEVQPL	ETQVASEASA	VPRTHPCPQC	SETFPTAATL
EAHKRGHTGP	RPFACAQCGK	AFPKAYLLKK	HQEVHVRERR	FRCGDCGKLY
KTIAHVRGHR	RVHSDERPYP	CPKCGKRYKT	KNAQQVHFRT	HLEEKPHVCQ
FCSRGFREKG	SLVRHVRHHT	GEKPFKCYKC	GRGFAEHGTL	NRHLRTKGGC
LLEVEELLVS	EDSPAAATTV	LTEDPHTVLV	EFSSVVADTQ	EYIIEATADD
AETSEATEII	EGTQTEVDSH	IMKVVQQIVH	QASAGHQIIV	QNVTMDEETA
LGPEAAAADT	ITIATPESLT	EQVAMTLASA	ISEGTVLAAR	AGTSGTEQAT
VTMVSSEDIE	ILEHAGELVI	ASPEGQLEVQ	TVIV

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дотрансфераз,репресорів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус,транскрипція, регуляціятранскрипції,клітинний цикл,поділ клітини,мітоз, убіквітинування білків, регуляція росту. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Fernandes E.R., Rooney R.J. (1997).The adenovirus E1A-regulated transcription factor E4F is generated from the human homolog of nuclear factor phiAP3.Mol. Cell. Biol.17: 1890—1903.PMID 9121437doi:10.1128/MCB.17.4.1890
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Fernandes E.R., Zhang J.Y., Rooney R.J. (1998).Adenovirus E1A-regulated transcription factor p120E4F inhibits cell growth and induces the stabilization of the cdk inhibitor p21WAF1.Mol. Cell. Biol.18: 459—467.PMID 9418893doi:10.1128/MCB.18.1.459
Rooney R.J., Rothammer K., Fernandes E.R. (1998). Mutational analysis of p50E4F suggests that DNA binding activity is mediated through an alternative structure in a zinc finger domain that is regulated by phosphorylation.Nucleic Acids Res.26: 1681—1688.PMID 9512539doi:10.1093/nar/26.7.1681
Fernandes E.R., Rooney R.J. (1999).Suppression of E1A-mediated transformation by the p50E4F transcription factor.Mol. Cell. Biol.19: 4739—4749.PMID 10373523doi:10.1128/MCB.19.7.4739
Colombo R., Draetta G.F., Chiocca S. (2003). Modulation of p120E4F transcriptional activity by the Gam1 adenoviral early protein.Oncogene.22: 2541—2547.PMID 12730668doi:10.1038/sj.onc.1206379

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3121 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q66K89 (англ.) . Архіворигіналу за 7 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 16

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=E4F1&oldid=46336096

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭