| E2F3 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | E2F3, E2F-3, E2F transcription factor 3 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM:600427MGI:1096340HomoloGene:74413GeneCards:E2F3 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •DNA binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein dimerization activity •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •transcription factor binding
|
|---|
| Клітинна компонента | •клітинне ядро •transcription regulator complex •RNA polymerase II transcription regulator complex •нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес | •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •negative regulation of fat cell proliferation •клітинний цикл •transcription initiation from RNA polymerase II promoter •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •transcription, DNA-templated •positive regulation of cell population proliferation •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •regulation of cell cycle
|
|---|
| Джерела:Amigo /QuickGO |
|
| Шаблонекспресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 6: 20.4 – 20.49 Mb | Хр. 13: 30.09 – 30.17 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
|
E2F3 (англ.E2F transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465амінокислот, амолекулярна маса — 49 162[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
| MRKGIQPALE | | QYLVTAGGGE | | GAAVVAAAAA | | ASMDKRALLA | | SPGFAAAAAA |
| AAAPGAYIQI | | LTTNTSTTSC | | SSSLQSGAVA | | AGPLLPSAPG | | AEQTAGSLLY |
| TTPHGPSSRA | | GLLQQPPALG | | RGGSGGGGGP | | PAKRRLELGE | | SGHQYLSDGL |
| KTPKGKGRAA | | LRSPDSPKTP | | KSPSEKTRYD | | TSLGLLTKKF | | IQLLSQSPDG |
| VLDLNKAAEV | | LKVQKRRIYD | | ITNVLEGIHL | | IKKKSKNNVQ | | WMGCSLSEDG |
| GMLAQCQGLS | | KEVTELSQEE | | KKLDELIQSC | | TLDLKLLTED | | SENQRLAYVT |
| YQDIRKISGL | | KDQTVIVVKA | | PPETRLEVPD | | SIESLQIHLA | | STQGPIEVYL |
| CPEETETHSP | | MKTNNQDHNG | | NIPKPASKDL | | ASTNSGHSDC | | SVSMGNLSPL |
| ASPANLLQQT | | EDQIPSNLEG | | PFVNLLPPLL | | QEDYLLSLGE | | EEGISDLFDA |
| YDLEKLPLVE | | DFMCS |
Кодований геном білок за функцією належить доактиваторів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,клітинний цикл,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1)Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1)Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|