Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

E2F1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

E2F1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H24,1O9K,2AZE

Ідентифікатори

Символи

E2F1, E2F-1, RBAP1, RBBP3, RBP3, E2F transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM:189971 MGI:101941 HomoloGene:3828 GeneCards:E2F1

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •transcription factor binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein dimerization activity •GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific •sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •protein kinase binding •GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •transcription regulator complex •Rb-E2F complex •клітинне ядро •мітохондрія •нуклеоплазма •центросома •GO:0009327 protein-containing complex •RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	•cellular response to nerve growth factor stimulus •negative regulation of fat cell differentiation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •lens fiber cell apoptotic process •negative regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle •positive regulation of fibroblast proliferation •negative regulation of DNA binding •negative regulation of fat cell proliferation •DNA damage checkpoint signaling •cellular response to xenobiotic stimulus •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription, DNA-templated •regulation of cell cycle •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle •mRNA stabilization •positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway •GO:1901313 positive regulation of gene expression •cellular response to fatty acid •anoikis •Сперматогенез •intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage •intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator •клітинний цикл •forebrain development •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •cellular response to hypoxia •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •GO:0097285 апоптоз •DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest •regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle •positive regulation of apoptotic process •negative regulation of G0 to G1 transition •positive regulation of glial cell proliferation
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1869


13555

Ensembl


ENSG00000101412


ENSMUSG00000027490

UniProt


Q01094


Q61501

RefSeq (мРНК)


NM_005225


NM_007891 NM_001291105

RefSeq (білок)


NP_005216


NP_001278034 NP_031917

Локус (UCSC)

Хр. 20: 33.68 – 33.69 Mb

Хр. 2: 154.4 – 154.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

E2F1 (англ.E2F transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437амінокислот, амолекулярна маса — 46 920^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALAGAPAGG	PCAPALEALL	GAGALRLLDS	SQIVIISAAQ	DASAPPAPTG
PAAPAAGPCD	PDLLLFATPQ	APRPTPSAPR	PALGRPPVKR	RLDLETDHQY
LAESSGPARG	RGRHPGKGVK	SPGEKSRYET	SLNLTTKRFL	ELLSHSADGV
VDLNWAAEVL	KVQKRRIYDI	TNVLEGIQLI	AKKSKNHIQW	LGSHTTVGVG
GRLEGLTQDL	RQLQESEQQL	DHLMNICTTQ	LRLLSEDTDS	QRLAYVTCQD
LRSIADPAEQ	MVMVIKAPPE	TQLQAVDSSE	NFQISLKSKQ	GPIDVFLCPE
ETVGGISPGK	TPSQEVTSEE	ENRATDSATI	VSPPPSSPPS	SLTTDPSQSL
LSLEQEPLLS	RMGSLRAPVD	EDRLSPLVAA	DSLLEHVRED	FSGLLPEEFI
SLSPPHEALD	YHFGLEEGEG	IRDLFDCDFG	DLTPLDF

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, якапоптоз,транскрипція, регуляціятранскрипції,клітинний цикл,ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Neuman E., Sellers W.R.S., McNeil J.A., Lawrence J.B., Kaelin W.G. Jr. (1996).Structure and partial genomic sequence of the human E2F1 gene.Gene.173: 163—169.PMID 8964493doi:10.1016/0378-1119(96)00184-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Johnson D.G., Ohtani K., Nevins J.R. (1994).Autoregulatory control of E2F1 expression in response to positive and negative regulators of cell cycle progression.Genes Dev.8: 1514—1525.PMID 7958836doi:10.1101/gad.8.13.1514
Helin K., Harlow E., Fattaey A. (1993).Inhibition of E2F-1 transactivation by direct binding of the retinoblastoma protein.Mol. Cell. Biol.13: 6501—6508.PMID 8413249doi:10.1128/MCB.13.10.6501
Dynlacht B.D., Flores O., Lees J.A., Harlow E. (1994).Differential regulation of E2F transactivation by cyclin/cdk2 complexes.Genes Dev.8: 1772—1786.PMID 7958856doi:10.1101/gad.8.15.1772
Xu M., Sheppard K.-A., Peng C.-Y., Yee A.S., Piwnica-Worms H. (1994).Cyclin A/CDK2 binds directly to E2F-1 and inhibits the DNA-binding activity of E2F-1/DP-1 by phosphorylation.Mol. Cell. Biol.14: 8420—8431.PMID 7969176doi:10.1128/MCB.14.12.8420

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3113 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q01094 (англ.) . Архіворигіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 20

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=E2F1&oldid=46673416

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭