Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

DNAJB1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

DNAJB1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1HDJ,2QLD,3AGX,3AGY,3AGZ,4WB7

Ідентифікатори

Символи

DNAJB1, HSPF1, Hdj1, Hsp40, RSPH16B, Sis1, DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B1

Зовнішні ІД

OMIM:604572 MGI:1931874 HomoloGene:55957 GeneCards:DNAJB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	•розгорнуте білкове зв’язування •ATPase binding •Hsp70 protein binding •chaperone binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •ATPase activator activity •GO:0001106 transcription corepressor activity •cadherin binding
Клітинна компонента	•гіалоплазма •ядерце •екзосома •клітинне ядро •нуклеоплазма •цитоплазма •GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення •soma •dendritic spine •sperm head •postsynapse •glutamatergic synapse
Біологічний процес	•regulation of cellular response to heat •response to unfolded protein •positive regulation of ATP-dependent activity •згортання білків •chaperone cofactor-dependent protein refolding •negative regulation of inclusion body assembly •negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •forebrain development
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3337


81489

Ensembl


ENSG00000132002


ENSMUSG00000005483

UniProt


P25685


Q9QYJ3

RefSeq (мРНК)


NM_001313964 NM_001300914 NM_006145


NM_018808 NM_001308227

RefSeq (білок)


NP_001287843 NP_001300893 NP_006136


NP_001295156 NP_061278

Локус (UCSC)

Хр. 19: 14.51 – 14.56 Mb

Хр. 8: 84.33 – 84.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DNAJB1 (англ.DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 340амінокислот, амолекулярна маса — 38 044^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKDYYQTLG	LARGASDEEI	KRAYRRQALR	YHPDKNKEPG	AEEKFKEIAE
AYDVLSDPRK	REIFDRYGEE	GLKGSGPSGG	SGGGANGTSF	SYTFHGDPHA
MFAEFFGGRN	PFDTFFGQRN	GEEGMDIDDP	FSGFPMGMGG	FTNVNFGRSR
SAQEPARKKQ	DPPVTHDLRV	SLEEIYSGCT	KKMKISHKRL	NPDGKSIRNE
DKILTIEVKK	GWKEGTKITF	PKEGDQTSNN	IPADIVFVLK	DKPHNIFKRD
GSDVIYPARI	SLREALCGCT	VNVPTLDGRT	IPVVFKDVIR	PGMRRKVPGE
GLPLPKTPEK	RGDLIIEFEV	IFPERIPQTS	RTVLEQVLPI

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дошаперонів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь настрес,альтернативний сплайсинг. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Raabe T., Manley J.L. (1991). A human homologue of the Escherichia coli DnaJ heat-shock protein.Nucleic Acids Res.19: 6645—6645.PMID 1754405doi:10.1093/nar/19.23.6645
Ohtsuka K. (1993). Cloning of a cDNA for heat-shock protein hsp40, a human homologue of bacterial DnaJ.Biochem. Biophys. Res. Commun.197: 235—240.PMID 8250930doi:10.1006/bbrc.1993.2466
Hata M., Okumura K., Seto M., Ohtsuka K. (1996). Genomic cloning of a human heat shock protein 40 (Hsp40) gene (HSPF1) and its chromosomal localization to 19p13.2.Genomics.38: 446—449.PMID 8975727doi:10.1006/geno.1996.0653
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Shi Y., Mosser D.D., Morimoto R.I. (1998). Molecular chaperones as HSF1-specific transcriptional repressors.Genes Dev.12: 654—666.PMID 9499401doi:10.1101/gad.12.5.654
Zhong X.Y., Ding J.H., Adams J.A., Ghosh G., Fu X.D. (2009). Regulation of SR protein phosphorylation and alternative splicing by modulating kinetic interactions of SRPK1 with molecular chaperones.Genes Dev.23: 482—495.PMID 19240134doi:10.1101/gad.1752109

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5270 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P25685 (англ.) . Архіворигіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.