DLX2 |
---|
 |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DLX2, TES-1, TES1, AW121999, Dlx-2, distal-less homeobox 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM:126255MGI:94902HomoloGene:3244GeneCards:DLX2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | •DNA binding •sequence-specific DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •chromatin binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •single-stranded RNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента | •клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес | •cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation •proximal/distal pattern formation •диференціація клітин •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •branching morphogenesis of a nerve •embryonic skeletal system development •multicellular organism development •odontogenesis of dentin-containing tooth •cerebral cortex GABAergic interneuron fate commitment •cartilage development •brain development •negative regulation of oligodendrocyte differentiation •forebrain neuron differentiation •embryonic cranial skeleton morphogenesis •olfactory bulb development •hippocampus development •subpallium development •negative regulation of Notch signaling pathway •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •positive regulation of cell differentiation •negative regulation of photoreceptor cell differentiation •positive regulation of amacrine cell differentiation •transcription, DNA-templated
|
---|
Джерела:Amigo /QuickGO |
|
Шаблонекспресії |
---|

 |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 172.1 – 172.1 Mb | Хр. 2: 71.37 – 71.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
|
DLX2 (англ.Distal-less homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328амінокислот, амолекулярна маса — 34 243[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
---|
MTGVFDSLVA | | DMHSTQIAAS | | STYHQHQQPP | | SGGGAGPGGN | | SSSSSSLHKP |
QESPTLPVST | | ATDSSYYTNQ | | QHPAGGGGGG | | GSPYAHMGSY | | QYQASGLNNV |
PYSAKSSYDL | | GYTAAYTSYA | | PYGTSSSPAN | | NEPEKEDLEP | | EIRIVNGKPK |
KVRKPRTIYS | | SFQLAALQRR | | FQKTQYLALP | | ERAELAASLG | | LTQTQVKIWF |
QNRRSKFKKM | | WKSGEIPSEQ | | HPGASASPPC | | ASPPVSAPAS | | WDFGVPQRMA |
GGGGPGSGGS | | GAGSSGSSPS | | SAASAFLGNY | | PWYHQTSGSA | | SHLQATAPLL |
HPTQTPQPHH | | HHHHHGGGGA | | PVSAGTIF |
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,білків розвитку,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції, диференціація,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1)Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|