Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

DDR1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

DDR1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
3ZOS,4AG4,4BKJ,4CKR,5BVK,5BVN,5BVO,5BVW,5FDP

Ідентифікатори

Символи

DDR1, CAK, CD167, DDR, EHGK2, MCK10, NEP, NTRK4, PTK3, PTK3A, RTK6, TRKE, discoidin domain receptor tyrosine kinase 1

Зовнішні ІД

OMIM:600408 MGI:99216 HomoloGene:68212 GeneCards:DDR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	•transferase activity •nucleotide binding •protein kinase activity •collagen binding •зв’язування з іоном металу •kinase activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity •protein tyrosine kinase collagen receptor activity •protein tyrosine kinase activity •ATP binding •receptor tyrosine kinase
Клітинна компонента	•integral component of membrane •мембрана •receptor complex •клітинна мембрана •integral component of plasma membrane •extracellular region •екзосома •міжклітинний простір
Біологічний процес	•collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway •branching involved in mammary gland duct morphogenesis •фосфорилювання •transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway •жіноча вагітність •extracellular matrix organization •ear development •mammary gland alveolus development •regulation of extracellular matrix disassembly •smooth muscle cell migration •smooth muscle cell-matrix adhesion •regulation of cell-matrix adhesion •protein phosphorylation •адгезія клітин •regulation of cell growth •peptidyl-tyrosine phosphorylation •лактація •wound healing, spreading of cells •embryo implantation •negative regulation of cell population proliferation •peptidyl-tyrosine autophosphorylation •protein autophosphorylation •axon development •neuron projection extension •cell-matrix adhesion •positive regulation of cell population proliferation •диференціація клітин •regulation of extracellular matrix organization
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


780


12305

Ensembl

ENSG00000215522 ENSG00000137332 ENSG00000229767 ENSG00000230456 ENSG00000234078
ENSG00000204580 ENSG00000223680


ENSMUSG00000003534

UniProt


Q08345


Q03146

RefSeq (мРНК)

NM_001202521 NM_001202522 NM_001202523 NM_001297652 NM_001297653
NM_001297654 NM_001954 NM_013993 NM_013994


NM_001198831 NM_001198833 NM_007584 NM_172962

RefSeq (білок)

NP_001189450 NP_001189451 NP_001189452 NP_001284581 NP_001284582
NP_001284583 NP_001945 NP_054699 NP_054700 NP_001284583.1 NP_054699.2


NP_001185760 NP_001185762 NP_031610 NP_766550

Локус (UCSC)

Хр. 6: 30.88 – 30.9 Mb

Хр. 17: 35.99 – 36.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DDR1 (англ.Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913амінокислот, амолекулярна маса — 101 128^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPEALSSLL	LLLLVASGDA	DMKGHFDPAK	CRYALGMQDR	TIPDSDISAS
SSWSDSTAAR	HSRLESSDGD	GAWCPAGSVF	PKEEEYLQVD	LQRLHLVALV
GTQGRHAGGL	GKEFSRSYRL	RYSRDGRRWM	GWKDRWGQEV	ISGNEDPEGV
VLKDLGPPMV	ARLVRFYPRA	DRVMSVCLRV	ELYGCLWRDG	LLSYTAPVGQ
TMYLSEAVYL	NDSTYDGHTV	GGLQYGGLGQ	LADGVVGLDD	FRKSQELRVW
PGYDYVGWSN	HSFSSGYVEM	EFEFDRLRAF	QAMQVHCNNM	HTLGARLPGG
VECRFRRGPA	MAWEGEPMRH	NLGGNLGDPR	ARAVSVPLGG	RVARFLQCRF
LFAGPWLLFS	EISFISDVVN	NSSPALGGTF	PPAPWWPPGP	PPTNFSSLEL
EPRGQQPVAK	AEGSPTAILI	GCLVAIILLL	LLIIALMLWR	LHWRRLLSKA
ERRVLEEELT	VHLSVPGDTI	LINNRPGPRE	PPPYQEPRPR	GNPPHSAPCV
PNGSALLLSN	PAYRLLLATY	ARPPRGPGPP	TPAWAKPTNT	QAYSGDYMEP
EKPGAPLLPP	PPQNSVPHYA	EADIVTLQGV	TGGNTYAVPA	LPPGAVGDGP
PRVDFPRSRL	RFKEKLGEGQ	FGEVHLCEVD	SPQDLVSLDF	PLNVRKGHPL
LVAVKILRPD	ATKNARNDFL	KEVKIMSRLK	DPNIIRLLGV	CVQDDPLCMI
TDYMENGDLN	QFLSAHQLED	KAAEGAPGDG	QAAQGPTISY	PMLLHVAAQI
ASGMRYLATL	NFVHRDLATR	NCLVGENFTI	KIADFGMSRN	LYAGDYYRVQ
GRAVLPIRWM	AWECILMGKF	TTASDVWAFG	VTLWEVLMLC	RAQPFGQLTD
EQVIENAGEF	FRDQGRQVYL	SRPPACPQGL	YELMLRCWSR	ESEQRPPFSQ
LHRFLAEDAL	NTV

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дотрансфераз,кіназ,рецепторів,тирозинових протеїнкіназ,фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, якальтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зАТФ,нуклеотидами, іонами металів, іономкальцію. Локалізований уклітинній мембрані, мембрані.Також секретований назовні.

Література

[ред. |ред. код]

Johnson J.D., Edman J.C., Rutter W.J. (1993). A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.90: 5677—5681.PMID 8390675doi:10.1073/pnas.90.12.5677
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Weiner T.M., Liu E.T., Craven R.J., Cance W.G. (1994). Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors.Ann. Surg. Oncol.1: 18—27.PMID 7834423doi:10.1007/BF02303537
Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen.Mol. Cell.1: 13—23.PMID 9659899doi:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
Hou G., Vogel W.F., Bendeck M.P. (2002).Tyrosine kinase activity of discoidin domain receptor 1 is necessary for smooth muscle cell migration and matrix metalloproteinase expression.Circ. Res.90: 1147—1149.PMID 12065315doi:10.1161/01.RES.0000022166.74073.F8
Huang Y., Arora P., McCulloch C.A., Vogel W.F. (2009). The collagen receptor DDR1 regulates cell spreading and motility by associating with myosin IIA.J. Cell Sci.122: 1637—1646.PMID 19401332doi:10.1242/jcs.046219

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2730 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q08345 (англ.) . Архіворигіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 6

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

п о р Білки:кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=DDR1&oldid=46671806

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭