Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

DCN

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

DCN

Ідентифікатори

Символи

DCN, Dcn, DC, DSPG2, PG40, PGII, PGS2, SLRR1B, mDcn, CSCD, decorin

Зовнішні ІД

OMIM:125255 MGI:94872 HomoloGene:22430 GeneCards:DCN

Пов'язані генетичні захворювання

congenital stromal corneal dystrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•collagen binding •protein N-terminus binding •protein kinase inhibitor activity •glycosaminoglycan binding •extracellular matrix binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •RNA binding •extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance
Клітинна компонента	•цитоплазма •GO:0005578 Позаклітинна матриця •lysosomal lumen •Golgi lumen •collagen type VI trimer •міжклітинний простір •extracellular region •collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	•glycosaminoglycan metabolic process •positive regulation of mitochondrial fission •negative regulation of protein kinase activity •positive regulation of autophagy •розвиток нирки •cytokine-mediated signaling pathway •placenta development •chondroitin sulfate biosynthetic process •response to mechanical stimulus •GO:0010260 старіння людини •extracellular matrix disassembly •extracellular matrix organization •Загоєння ран •negative regulation of endothelial cell migration •positive regulation of macroautophagy •response to lipopolysaccharide •positive regulation of mitochondrial depolarization •animal organ morphogenesis •chondroitin sulfate catabolic process •negative regulation of angiogenesis •positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling •peptide cross-linking via chondroitin 4-sulfate glycosaminoglycan •negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway •dermatan sulfate biosynthetic process •skeletal muscle tissue development •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1634


13179

Ensembl


ENSG00000011465


ENSMUSG00000019929

UniProt


P07585


P28654

RefSeq (мРНК)

NM_001920 NM_133503 NM_133504 NM_133505 NM_133506
NM_133507


NM_001190451 NM_007833

RefSeq (білок)

NP_001911 NP_598010 NP_598011 NP_598012 NP_598013
NP_598014


NP_001177380 NP_031859

Локус (UCSC)

Хр. 12: 91.14 – 91.18 Mb

Хр. 10: 97.32 – 97.35 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DCN (англ.Decorin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359амінокислот, амолекулярна маса — 39 747^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKATIILLLL	AQVSWAGPFQ	QRGLFDFMLE	DEASGIGPEV	PDDRDFEPSL
GPVCPFRCQC	HLRVVQCSDL	GLDKVPKDLP	PDTTLLDLQN	NKITEIKDGD
FKNLKNLHAL	ILVNNKISKV	SPGAFTPLVK	LERLYLSKNQ	LKELPEKMPK
TLQELRAHEN	EITKVRKVTF	NGLNQMIVIE	LGTNPLKSSG	IENGAFQGMK
KLSYIRIADT	NITSIPQGLP	PSLTELHLDG	NKISRVDAAS	LKGLNNLAKL
GLSFNSISAV	DNGSLANTPH	LRELHLDNNK	LTRVPGGLAE	HKYIQVVYLH
NNNISVVGSS	DFCPPGHNTK	KASYSGVSLF	SNPVQYWEIQ	PSTFRCVYVR
SAIQLGNYK

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, якальтернативний сплайсинг. Локалізований упозаклітинному матриксі.Також секретований назовні.

Література

[ред. |ред. код]

Krusius T., Ruoslahti E. (1986). Primary structure of an extracellular matrix proteoglycan core protein deduced from cloned cDNA.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.83: 7683—7687.PMID 3484330doi:10.1073/pnas.83.20.7683
Vetter U., Vogel W., Just W., Young M.F., Fisher L.W. (1993). Human decorin gene: intron-exon junctions and chromosomal localization.Genomics.15: 161—168.PMID 8432527doi:10.1006/geno.1993.1023
Danielson K.G., Fazzio A., Cohen I.R., Cannizzaro L., Iozzo R.V. (1993). The human decorin gene: intron-exon organization, discovery of two alternatively spliced exons in the 5' untranslated region, and mapping of the gene to chromosome 12q23.Genomics.15: 146—160.PMID 8432526doi:10.1006/geno.1993.1022
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Roughley P.J., White R.J. (1989).Dermatan sulphate proteoglycans of human articular cartilage. The properties of dermatan sulphate proteoglycans I and II.Biochem. J.262: 823—827.PMID 2590169doi:10.1042/bj2620823
Bredrup C., Knappskog P.M., Majewski J., Rodahl E., Boman H. (2005).Congenital stromal dystrophy of the cornea caused by a mutation in the decorin gene.Invest. Ophthalmol. Vis. Sci.46: 420—426.PMID 15671264doi:10.1167/iovs.04-0804

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з DCN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2705 (англ.) . Архіворигіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.[Архівовано 2017-09-23 уWayback Machine.]
↑UniProt, P07585 (англ.) . Архіворигіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 12

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фібрилярні білки

Позаклітинний матрикс

Колаген

Фібрилотворчі	тип І COL1A1 COL1A2 тип ІІ (COL2A1) тип ІІІ COL3A1 тип V COL5A1 COL5A2 COL5A3 COL24A1 COL26A1
Інші	FACIT:тип IX COL9A1 COL9A2 COL9A3 тип XII (COL12A1) COL14A1 COL16A1 COL19A1 COL20A1 COL21A1 COL22A1 базальна мембрана:тип IV COL4A1 COL4A2 COL4A3 COL4A4 COL4A5 COL4A6 мультиплексин:COL15A1 тип XVIII COL18A1 Ендостатин трансмембрана:COL13A1 COL17A1 COL23A1 COL25A1 інші:тип VI COL6A1 COL6A2 COL6A3 COL6A5 тип VII COL7A1 тип VIII COL8A1 COL8A2 тип X (COL10A1) тип XI COL11A1 COL11A2 COL27A1 COL28A1
Ензими	Пролілгідроксилаза/Лізилгідроксилаза CRTAP/Лепрекан ADAMTS2 Проколаген пептидаза Лізилоксидаза

Ламінін

альфа
бета
гамма

Інші

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=DCN&oldid=46671767

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭