Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

CSF2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

CSF2

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CSG,2GMF,4NKQ,5C7X,5D70,5D71,5D72,4RS1

Ідентифікатори

Символи

CSF2, GMCSF, colony stimulating factor 2, CSF

Зовнішні ІД

OMIM:138960 MGI:1339752 HomoloGene:600 GeneCards:CSF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	•growth factor activity •granulocyte macrophage colony-stimulating factor receptor binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein tyrosine kinase activity •cytokine activity
Клітинна компонента	•extracellular region •внутрішньоклітинна мембранна органела •міжклітинний простір
Біологічний процес	•negative regulation of cytolysis •positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation •regulation of cell population proliferation •MAPK cascade •positive regulation of podosome assembly •negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand •positive regulation of interleukin-23 production •GO:1901313 positive regulation of gene expression •embryonic placenta development •epithelial fluid transport •регуляція експресії генів •dendritic cell differentiation •myeloid dendritic cell differentiation •macrophage activation •cellular response to lipopolysaccharide •GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь •monocyte differentiation •response to fluid shear stress •response to silicon dioxide •neutrophil differentiation •peptidyl-tyrosine phosphorylation •regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep •histamine secretion •positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein •cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus •regulation of myeloid cell differentiation •regulation of signaling receptor activity •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •cytokine-mediated signaling pathway •positive regulation of cell population proliferation •macrophage differentiation
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1437


12981

Ensembl


ENSG00000164400


ENSMUSG00000018916

UniProt


P04141


P01587

RefSeq (мРНК)


NM_000758


NM_009969

RefSeq (білок)


NP_000749


NP_034099

Локус (UCSC)

Хр. 5: 132.07 – 132.08 Mb

Хр. 11: 54.14 – 54.14 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CSF2 (англ.Colony stimulating factor 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 144амінокислот, амолекулярна маса — 16 295^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWLQSLLLLG	TVACSISAPA	RSPSPSTQPW	EHVNAIQEAR	RLLNLSRDTA
AEMNETVEVI	SEMFDLQEPT	CLQTRLELYK	QGLRGSLTKL	KGPLTMMASH
YKQHCPPTPE	TSCATQIITF	ESFKENLKDF	LLVIPFDCWE	PVQE

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доцитокінів,факторів росту.Задіяний у такому біологічному процесі, як поліморфізм.Секретований назовні.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Kaushansky K., Lopez J.A., Brown C.B. (1992). Role of carbohydrate modification in the production and secretion of human granulocyte macrophage colony-stimulating factor in genetically engineered and normal mesenchymal cells.Biochemistry.31: 1881—1886.PMID 1737041doi:10.1021/bi00121a042
Diederichs K., Boone T., Karplus P.A. (1991). Novel fold and putative receptor binding site of granulocyte-macrophage colony-stimulating factor.Science.254: 1779—1782.PMID 1837174doi:10.1126/science.1837174
Miyatake S., Otsuka T., Yokota T., Lee F., Arai K. (1985). Structure of the chromosomal gene for granulocyte-macrophage colony stimulating factor: comparison of the mouse and human genes.EMBO J.4: 2561—2568.PMID 3876930