Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

CELF1

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

CELF1

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CPZ,2DHS,2RQ4,2RQC,3NMR,3NNA,3NNC,3NNH

Ідентифікатори

Символи

CELF1, BRUNOL2, CUG-BP, CUGBP, CUGBP1, EDEN-BP, NAB50, NAPOR, hNab50, CUGBP, Elav-like family member 1, CUGBP Elav-like family member 1

Зовнішні ІД

OMIM:601074 MGI:1342295 HomoloGene:136342 GeneCards:CELF1

Пов'язані генетичні захворювання

хвороба Альцгеймера^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•translation repressor activity, mRNA regulatory element binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •RNA binding •nucleic acid binding •BRE binding •mRNA binding •pre-mRNA binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •мембрана •нуклеоплазма •клітинне ядро •Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	•germ cell development •embryo development •mRNA processing •GO:0035194 РНК-інтерференція •regulation of RNA splicing •Сплайсинг РНК •negative regulation of translation •mRNA splice site selection •regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome •embryo development ending in birth or egg hatching
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10658


13046

Ensembl


ENSG00000149187


ENSMUSG00000005506

UniProt


Q92879


P28659

RefSeq (мРНК)

NM_001025596 NM_001172639 NM_001172640 NM_006560 NM_198700
NM_001330272


NM_001244891 NM_001244903 NM_017368 NM_198683

RefSeq (білок)

NP_001020767
NP_001166110
NP_001166111
NP_001317201
NP_006551

NP_941989
NP_001363298
NP_001363299
NP_001363300
NP_001363301
NP_001363302
NP_001363303
NP_001363305
NP_001363306
NP_001363307
NP_001363308
NP_001363309
NP_001363310
NP_001363311
NP_001363312
NP_001363313
NP_001363314
NP_001363315
NP_001363316
NP_001363317
NP_001363318
NP_001363319
NP_001363320
NP_001363322
NP_001363324
NP_001363325
NP_001363326
NP_001363328
NP_001363335
NP_001363336
NP_001363337
NP_001363338
NP_001363339
NP_001363340
NP_001363341
NP_001363342
NP_001363343
NP_001363344
NP_001363346
NP_001363347
NP_001363348
NP_001363349
NP_001363350
NP_001363351
NP_001363352
NP_001363353
NP_001363354
NP_001363355
NP_001363356
NP_001363357
NP_001363358
NP_001363359
NP_001363360
NP_001363361
NP_001363362
NP_001363363
NP_001363364
NP_001363365
NP_001363366
NP_001363367
NP_001363368
NP_001363369
NP_001363370
NP_001363371
NP_001363372
NP_001363373
NP_001363374
NP_001363375
NP_001363376
NP_001363377
NP_001363378
NP_001363379
NP_001363380
NP_001363381
NP_001363382
NP_001363383
NP_001363384
NP_001363385
NP_001363386
NP_001363387
NP_001363388
NP_001363389
NP_001363390
NP_001363391
NP_001363392
NP_001363304

NP_001231820 NP_001231832 NP_059064 NP_941955 NP_001393093
NP_001393094 NP_001393095 NP_001393096 NP_001393097 NP_001393098 NP_001393099 NP_001393100 NP_001393101 NP_001393102 NP_001393103 NP_001393104 NP_001393105 NP_001393106 NP_001393107 NP_001393108 NP_001393109 NP_001393110 NP_001393111 NP_001393112 NP_001393113

Локус (UCSC)

Хр. 11: 47.47 – 47.57 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CELF1 (англ.CUGBP Elav-like family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486амінокислот, амолекулярна маса — 52 063^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGTLDHPDQ	PDLDAIKMFV	GQVPRTWSEK	DLRELFEQYG	AVYEINVLRD
RSQNPPQSKG	CCFVTFYTRK	AALEAQNALH	NMKVLPGMHH	PIQMKPADSE
KNNAVEDRKL	FIGMISKKCT	ENDIRVMFSS	FGQIEECRIL	RGPDGLSRGC
AFVTFTTRAM	AQTAIKAMHQ	AQTMEGCSSP	MVVKFADTQK	DKEQKRMAQQ
LQQQMQQISA	ASVWGNLAGL	NTLGPQYLAL	YLQLLQQTAS	SGNLNTLSSL
HPMGGLNAMQ	LQNLAALAAA	ASAAQNTPSG	TNALTTSSSP	LSVLTSSGSS
PSSSSSNSVN	PIASLGALQT	LAGATAGLNV	GSLAGMAALN	GGLGSSGLSN
GTGSTMEALT	QAYSGIQQYA	AAALPTLYNQ	NLLTQQSIGA	AGSQKEGPEG
ANLFIYHLPQ	EFGDQDLLQM	FMPFGNVVSA	KVFIDKQTNL	SKCFGFVSYD
NPVSAQAAIQ	SMNGFQIGMK	RLKVQLKRSK	NDSKPY

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, якпроцесинг мРНК,сплайсинг мРНК, ацетилювання,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зРНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator.J. Biol. Chem.275: 28583—28592.PMID 10893231doi:10.1074/jbc.M003083200
Paillard L., Legagneux V., Maniey D., Osborne H.B. (2002). c-Jun ARE targets mRNA deadenylation by an EDEN-BP (embryo deadenylation element-binding protein)-dependent pathway.J. Biol. Chem.277: 3232—3235.PMID 11707455doi:10.1074/jbc.M109362200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Timchenko N.A., Welm A.L., Lu X., Timchenko L.T. (1999). CUG repeat binding protein (CUGBP1) interacts with the 5' region of C/EBPbeta mRNA and regulates translation of C/EBPbeta isoforms.Nucleic Acids Res.27: 4517—4525.PMID 10536163doi:10.1093/nar/27.22.4517
Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001).The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing.Mol. Cell. Biol.21: 1285—1296.PMID 11158314doi:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
Paillard L., Legagneux V., Beverley Osborne H. (2003). A functional deadenylation assay identifies human CUG-BP as a deadenylation factor.Biol. Cell.95: 107—113.PMID 12799066doi:10.1016/S0248-4900(03)00010-8