CEBPE Ідентифікатори Символи CEBPE Зовнішні ІД OMIM :600749 MGI: 103572 HomoloGene: 1367 GeneCards: CEBPE Пов'язані генетичні захворювання Гострий лімфобластний лейкоз ,lymphoblastic leukemia [ 1] Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес • defense response • myeloid cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • defense response to bacterium • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • macrophage differentiation • Фагоцитоз • transcription by RNA polymerase II • granulocyte differentiation
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 14: 23.12 – 23.12 Mb Хр. 14: 54.95 – 54.95 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
CEBPE (англ. CCAAT/enhancer binding protein epsilon ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , амолекулярна маса — 30 603[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSHGTYYECE PRGGQQPLEF SGGRAGPGEL GDMCEHEASI DLSAYIESGE EQLLSDLFAV KPAPEARGLK GPGTPAFPHY LPPDPRPFAY PPHTFGPDRK ALGPGIYSSP GSYDPRAVAV KEEPRGPEGS RAASRGSYNP LQYQVAHCGQ TAMHLPPTLA APGQPLRVLK APLATAAPPC SPLLKAPSPA GPLHKGKKAV NKDSLEYRLR RERNNIAVRK SRDKAKRRIL ETQQKVLEYM AENERLRSRV EQLTQELDTL RNLFRQIPEA ANLIKGVGGC S
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції . Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Antonson P., Stellan B., Yamanaka R., Xanthopoulos K.G. (1996). A novel human CCAAT/enhancer binding protein gene, C/EBPepsilon, is expressed in cells of lymphoid and myeloid lineages and is localized on chromosome 14q11.2 close to the T-cell receptor alpha/delta locus.Genomics .35 : 30—38. PMID 8661101 doi :10.1006/geno.1996.0319 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
