Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

CEBPA

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

CEBPA

Ідентифікатори

Символи

CEBPA, C/EBP-alpha, CEBP, CCAAT/enhancer binding protein alpha, CCAAT enhancer binding protein alpha

Зовнішні ІД

OMIM:116897 MGI:99480 HomoloGene:3211 GeneCards:CEBPA

Пов'язані генетичні захворювання

гострий мієлоїдний лейкоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •sequence-specific DNA binding •protein homodimerization activity •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001105 transcription coactivator activity •transcription factor binding •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •kinase binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•transcription regulator complex •RNA polymerase II transcription regulator complex •ядерце •клітинне ядро •нуклеоплазма •внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	•Сигнальний шлях Notch •transcription by RNA polymerase I •myeloid cell differentiation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •cellular response to lithium ion •glucose homeostasis •negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity •lung development •cytokine-mediated signaling pathway •цикл сечовини •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound •mitochondrion organization •embryonic placenta development •cholesterol metabolic process •negative regulation of cell cycle •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •cell maturation •generation of precursor metabolites and energy •transcription, DNA-templated •macrophage differentiation •multicellular organism development •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •positive regulation of osteoblast differentiation •granulocyte differentiation •regulation of cell population proliferation •brown fat cell differentiation •lipid homeostasis •white fat cell differentiation •inner ear development •liver development •GO:0022415 viral process •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of fat cell differentiation •positive regulation of transcription by RNA polymerase III •fat cell differentiation •positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of cell population proliferation •transcription by RNA polymerase II •cellular response to tumor necrosis factor •positive regulation of DNA-templated transcription, initiation •positive regulation of macrophage activation •positive regulation of inflammatory response •interleukin-6-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo /QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1050


12606

Ensembl


ENSG00000245848


ENSMUSG00000034957

UniProt


P49715


P53566

RefSeq (мРНК)


NM_004364 NM_001285829 NM_001287424 NM_001287435


NM_001287514 NM_001287515 NM_001287521 NM_001287523 NM_007678

RefSeq (білок)


NP_001272758 NP_001274353 NP_001274364 NP_004355


NP_001274443 NP_001274444 NP_001274450 NP_001274452 NP_031704

Локус (UCSC)

Хр. 19: 33.3 – 33.3 Mb

Хр. 7: 34.82 – 34.82 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CEBPA (англ.CCAAT/enhancer binding protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358амінокислот, амолекулярна маса — 37 561^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESADFYEAE	PRPPMSSHLQ	SPPHAPSSAA	FGFPRGAGPA	QPPAPPAAPE
PLGGICEHET	SIDISAYIDP	AAFNDEFLAD	LFQHSRQQEK	AKAAVGPTGG
GGGGDFDYPG	APAGPGGAVM	PGGAHGPPPG	YGCAAAGYLD	GRLEPLYERV
GAPALRPLVI	KQEPREEDEA	KQLALAGLFP	YQPPPPPPPS	HPHPHPPPAH
LAAPHLQFQI	AHCGQTTMHL	QPGHPTPPPT	PVPSPHPAPA	LGAAGLPGPG
SALKGLGAAH	PDLRASGGSG	AGKAKKSVDK	NSNEYRVRRE	RNNIAVRKSR
DKAKQRNVET	QQKVLELTSD	NDRLRKRVEQ	LSRELDTLRG	IFRQLPESSL
VKAMGNCA

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,білків розвитку,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус,транскрипція, регуляціятранскрипції,ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Antonson P., Xanthopoulos K.G. (1995). Molecular cloning, sequence, and expression patterns of the human gene encoding CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBP alpha).Biochem. Biophys. Res. Commun.215: 106—113.PMID 7575576doi:10.1006/bbrc.1995.2439
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Choi B.H., Park G.T., Rho H.M. (1999).Interaction of hepatitis B viral X protein and CCAAT/enhancer-binding protein alpha synergistically activates the hepatitis B viral enhancer II/pregenomic promoter.J. Biol. Chem.274: 2858—2865.PMID 9915821doi:10.1074/jbc.274.5.2858
Wang G.L., Iakova P., Wilde M., Awad S., Timchenko N.A. (2004).Liver tumors escape negative control of proliferation via PI3K/Akt-mediated block of C/EBP alpha growth inhibitory activity.Genes Dev.18: 912—925.PMID 15107404doi:10.1101/gad.1183304
Muller C., Calkhoven C.F., Sha X., Leutz A. (2004).The CCAAT enhancer-binding protein alpha (C/EBPalpha) requires a SWI/SNF complex for proliferation arrest.J. Biol. Chem.279: 7353—7358.PMID 14660596doi:10.1074/jbc.M312709200
Smith M.L., Cavenagh J.D., Lister T.A., Fitzgibbon J. (2004).Mutation of CEBPA in familial acute myeloid leukemia.N. Engl. J. Med.351: 2403—2407.PMID 15575056doi:10.1056/NEJMoa041331

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з CEBPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1833 (англ.) . Архіворигіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.[Архівовано 2017-07-31 уWayback Machine.]
↑UniProt, P49715 (англ.) . Архіворигіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 19

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=CEBPA&oldid=46655849

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭