Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

CDH2

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

CDH2

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1NCG,1NCH,1NCI,1NCJ,1OP4,2QVI,3Q2W,4NUM,4NUP,4NUQ

Ідентифікатори

Символи

CDH2, CD325, CDHN, CDw325, NCAD, cadherin 2, ACOGS, ARVD14

Зовнішні ІД

OMIM:114020 MGI:88355 HomoloGene:20424 GeneCards:CDH2

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•calcium ion binding •gamma-catenin binding •зв’язування з іоном металу •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •enzyme binding •protein phosphatase binding •alpha-catenin binding •protein kinase binding •beta-catenin binding •identical protein binding •cytoskeletal protein binding •protein homodimerization activity •cadherin binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •integral component of membrane •мембрана •intercalated disc •cell-cell junction •focal adhesion •plasma membrane raft •Адгезивні контакти •клітинна мембрана •синапс •basolateral plasma membrane •apical plasma membrane •cortical actin cytoskeleton •catenin complex •fascia adherens •екзосома •lamellipodium •GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення •Сарколема •endoplasmic reticulum lumen •cell surface •міжклітинні контакти •GO:0005578 Позаклітинна матриця •integral component of plasma membrane •neuron projection •apical part of cell •collagen-containing extracellular matrix •integral component of presynaptic active zone membrane •integral component of postsynaptic specialization membrane
Біологічний процес	•calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules •heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules •blood vessel morphogenesis •homeostasis of number of cells •positive regulation of muscle cell differentiation •regulation of postsynaptic density protein 95 clustering •glial cell differentiation •neuroepithelial cell differentiation •cell-cell adhesion mediated by cadherin •radial glial cell differentiation •neuronal stem cell population maintenance •regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation •telencephalon development •neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly •positive regulation of synaptic vesicle clustering •адгезія клітин •regulation of signal transduction •cerebral cortex development •striated muscle cell differentiation •adherens junction organization •cell migration •negative regulation of canonical Wnt signaling pathway •positive regulation of MAPK cascade •homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules •brain morphogenesis •посттрансляційна модифікація •protein localization to plasma membrane •GO:0000767 cell morphogenesis •cell-cell junction assembly •synapse assembly •regulation of axonogenesis •regulation of synaptic transmission, glutamatergic •cell-cell adhesion
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1000


12558

Ensembl


ENSG00000170558


ENSMUSG00000024304

UniProt


P19022


P15116

RefSeq (мРНК)


NM_001308176 NM_001792


NM_007664

RefSeq (білок)


NP_001295105 NP_001783 NP_001783.2


NP_031690

Локус (UCSC)

Хр. 18: 27.93 – 28.18 Mb

Хр. 18: 16.72 – 16.94 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH2 (англ.Cadherin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906амінокислот, амолекулярна маса — 99 809^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCRIAGALRT	LLPLLAALLQ	ASVEASGEIA	LCKTGFPEDV	YSAVLSKDVH
EGQPLLNVKF	SNCNGKRKVQ	YESSEPADFK	VDEDGMVYAV	RSFPLSSEHA
KFLIYAQDKE	TQEKWQVAVK	LSLKPTLTEE	SVKESAEVEE	IVFPRQFSKH
SGHLQRQKRD	WVIPPINLPE	NSRGPFPQEL	VRIRSDRDKN	LSLRYSVTGP
GADQPPTGIF	IINPISGQLS	VTKPLDREQI	ARFHLRAHAV	DINGNQVENP
IDIVINVIDM	NDNRPEFLHQ	VWNGTVPEGS	KPGTYVMTVT	AIDADDPNAL
NGMLRYRIVS	QAPSTPSPNM	FTINNETGDI	ITVAAGLDRE	KVQQYTLIIQ
ATDMEGNPTY	GLSNTATAVI	TVTDVNDNPP	EFTAMTFYGE	VPENRVDIIV
ANLTVTDKDQ	PHTPAWNAVY	RISGGDPTGR	FAIQTDPNSN	DGLVTVVKPI
DFETNRMFVL	TVAAENQVPL	AKGIQHPPQS	TATVSVTVID	VNENPYFAPN
PKIIRQEEGL	HAGTMLTTFT	AQDPDRYMQQ	NIRYTKLSDP	ANWLKIDPVN
GQITTIAVLD	RESPNVKNNI	YNATFLASDN	GIPPMSGTGT	LQIYLLDIND
NAPQVLPQEA	ETCETPDPNS	INITALDYDI	DPNAGPFAFD	LPLSPVTIKR
NWTITRLNGD	FAQLNLKIKF	LEAGIYEVPI	IITDSGNPPK	SNISILRVKV
CQCDSNGDCT	DVDRIVGAGL	GTGAIIAILL	CIIILLILVL	MFVVWMKRRD
KERQAKQLLI	DPEDDVRDNI	LKYDEEGGGE	EDQDYDLSQL	QQPDTVEPDA
IKPVGIRRMD	ERPIHAEPQY	PVRSAAPHPG	DIGDFINEGL	KAADNDPTAP
PYDSLLVFDY	EGSGSTAGSL	SSLNSSSSGG	EQDYDYLNDW	GPRFKKLADM
YGGGDD

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономкальцію. Локалізований уклітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

[ред. |ред. код]

Reid R.A., Hemperly J.J. (1990).Human N-cadherin: nucleotide and deduced amino acid sequence.Nucleic Acids Res.18: 5896—5896.PMID 2216790doi:10.1093/nar/18.19.5896
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Wallis J.A., Fox M., Walsh F.S. (1994). Structure of the human N-cadherin gene: YAC analysis and fine chromosomal mapping to 18q11.2.Genomics.22: 172—179.PMID 7959764doi:10.1006/geno.1994.1358
Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases.Oncogene.24: 5333—5343.PMID 16007225doi:10.1038/sj.onc.1208582
Salomon D., Ayalon O., Patel-King R., Hynes R.O., Geiger B. (1992).Extrajunctional distribution of N-cadherin in cultured human endothelial cells.J. Cell Sci.102: 7—17.PMID 1500442

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з CDH2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1759 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P19022 (англ.) . Архіворигіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 18

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

п о р Білки:кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=CDH2&oldid=46653172

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭