Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

CD40

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

CD40

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CZZ,1D00,1FLL,1LB6,3QD6,5DMJ,5IHL,5DMI

Ідентифікатори

Символи

CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule

Зовнішні ІД

OMIM:109535 MGI:88336 HomoloGene:954 GeneCards:CD40

Пов'язані генетичні захворювання

ревматоїдний артрит,CD40 deficiency^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0003823, GO:0051635 antigen binding •signal transducer activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •tumor necrosis factor-activated receptor activity •enzyme binding •ubiquitin protein ligase binding •protein domain specific binding •signaling receptor activity
Клітинна компонента	•цитоплазма •integral component of membrane •внутрішньоклітинна мембранна органела •мембрана •клітинна мембрана •integral component of plasma membrane •extracellular region •cell surface •CD40 receptor complex •екзосома •external side of plasma membrane •міжклітинний простір •soma •varicosity
Біологічний процес	•positive regulation of protein phosphorylation •positive regulation of MAP kinase activity •positive regulation of interleukin-12 production •protein kinase B signaling •positive regulation of protein kinase C signaling •процес імунної системи •cellular calcium ion homeostasis •tumor necrosis factor-mediated signaling pathway •immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway •platelet activation •multicellular organism development •B cell activation •GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity •response to lipopolysaccharide •B cell proliferation •cellular response to mechanical stimulus •positive regulation of endothelial cell apoptotic process •regulation of cell population proliferation •positive regulation of B cell proliferation •positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity •defense response to virus •GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь •regulation of immune response •positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling •apoptotic signaling pathway •positive regulation of isotype switching to IgG isotypes •cellular response to lipopolysaccharide •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •defense response to protozoan •response to bacterium •response to nutrient levels •response to cobalamin •response to interferon-gamma •cellular response to erythropoietin •cellular response to interleukin-1 •cellular response to tumor necrosis factor •response to peptide •inflammatory response •positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein •positive regulation of blood vessel endothelial cell migration •positive regulation of angiogenesis •GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


958


21939

Ensembl


ENSG00000101017


ENSMUSG00000017652

UniProt


P25942


P27512

RefSeq (мРНК)

NM_001250 NM_001302753 NM_152854 NM_001322421 NM_001322422
NM_001362758


NM_011611 NM_170702 NM_170703 NM_170704

RefSeq (білок)

NP_001241 NP_001289682 NP_001309350 NP_001309351 NP_690593
NP_001349687


NP_035741 NP_733803 NP_733804 NP_733805

Локус (UCSC)

Хр. 20: 46.12 – 46.13 Mb

Хр. 2: 164.9 – 164.91 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CD40 (англ.CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277амінокислот, амолекулярна маса — 30 619^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRLPLQCVL	WGCLLTAVHP	EPPTACREKQ	YLINSQCCSL	CQPGQKLVSD
CTEFTETECL	PCGESEFLDT	WNRETHCHQH	KYCDPNLGLR	VQQKGTSETD
TICTCEEGWH	CTSEACESCV	LHRSCSPGFG	VKQIATGVSD	TICEPCPVGF
FSNVSSAFEK	CHPWTSCETK	DLVVQQAGTN	KTDVVCGPQD	RLRALVVIPI
IFGILFAILL	VLVFIKKVAK	KPTNKAPHPK	QEPQEINFPD	DLPGSNTAAP
VQETLHGCQP	VTQEDGKESR	ISVQERQ

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дорецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, якімунітет,альтернативний сплайсинг. Локалізований уклітинній мембрані, мембрані.Також секретований назовні.

Література

[ред. |ред. код]

Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.98: 1751—1756.PMID 11172023doi:10.1073/pnas.98.4.1751
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.Protein Sci.13: 2819—2824.PMID 15340161doi:10.1110/ps.04682504
Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995).A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40.FEBS Lett.358: 113—118.PMID 7530216doi:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40.Proteins.27: 59—70.PMID 9037712doi:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989).A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas.EMBO J.8: 1403—1410.PMID 2475341

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з CD40 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11919 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, P25942 (англ.) . Архіворигіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 20

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

п о р Білки:кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=CD40&oldid=46649669

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭