Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

CBFA2T3

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

CBFA2T3

Ідентифікатори

Символи

CBFA2T3, ETO2, MTG16, MTGR2, ZMYND4, RUNX1T3, CBFA2/RUNX1 translocation partner 3, CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 3

Зовнішні ІД

OMIM:603870 MGI:1338013 HomoloGene:74543 GeneCards:CBFA2T3

Онтологія гена
Молекулярна функція	•GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •зв'язування з іоном металу •GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	•Golgi membrane •комплекс Ґольджі •ядерце •мембрана •клітинне ядро •нуклеоплазма
Біологічний процес	•regulation of aerobic respiration •диференціація клітин •проліферація •negative regulation of glycolytic process •response to hypoxia •granulocyte differentiation •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process •transcription, DNA-templated •negative regulation of cell population proliferation •GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


863


12398

Ensembl


ENSG00000129993


ENSMUSG00000006362

UniProt


O75081


O54972

RefSeq (мРНК)


NM_005187 NM_175931


NM_001109873 NM_009824 NM_177289

RefSeq (білок)


NP_005178 NP_787127


NP_001103343 NP_033954 NP_796263

Локус (UCSC)

Хр. 16: 88.87 – 88.98 Mb

Хр. 8: 123.35 – 123.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CBFA2T3 (англ.CBFA2/RUNX1 translocation partner 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 653амінокислот, амолекулярна маса — 71 192^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPASRLRDRA	ASSASGSTCG	SMSQTHPVLE	SGLLASAGCS	APRGPRKGGP
APVDRKAKAS	AMPDSPAEVK	TQPRSTPPSM	PPPPPAASQG	ATRPPSFTPH
THREDGPATL	PHGRFHGCLK	WSMVCLLMNG	SSHSPTAING	APCTPNGFSN
GPATSSTASL	STQHLPPACG	ARQLSKLKRF	LTTLQQFGSD	ISPEIGERVR
TLVLGLVNST	LTIEEFHSKL	QEATNFPLRP	FVIPFLKANL	PLLQRELLHC
ARLAKQTPAQ	YLAQHEQLLL	DASASSPIDS	SELLLEVNEN	GKRRTPDRTK
ENGSDRDPLH	PEHLSKRPCT	LNPAQRYSPS	NGPPQPTPPP	HYRLEDIAMA
HHFRDAYRHP	DPRELRERHR	PLVVPGSRQE	EVIDHKLTER	EWAEEWKHLN
NLLNCIMDMV	EKTRRSLTVL	RRCQEADREE	LNHWARRYSD	AEDTKKGPAP
AAARPRSSSA	GPEGPQLDVP	REFLPRTLTG	YVPEDIWRKA	EEAVNEVKRQ
AMSELQKAVS	DAERKAHELI	TTERAKMERA	LAEAKRQASE	DALTVINQQE
DSSESCWNCG	RKASETCSGC	NAARYCGSFC	QHRDWEKHHH	VCGQSLQGPT
AVVADPVPGP	PEAAHSLGPS	LPVGAASPSE	AGSAGPSRPG	SPSPPGPLDT
VPR

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,диференціація клітин,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку. Локалізований уядрі, мембрані,апараті гольджі.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Calabi F., Cilli V. (1998). CBFA2T1, a gene rearranged in human leukemia, is a member of a multigene family.Genomics.52: 332—341.PMID 9790752doi:10.1006/geno.1998.5429
Schillace R.V., Andrews S.F., Liberty G.A., Davey M.P., Carr D.W. (2002). Identification and characterization of myeloid translocation gene 16b as a novel a kinase anchoring protein in T lymphocytes.J. Immunol.168: 1590—1599.PMID 11823486doi:10.4049/jimmunol.168.4.1590
Davis J.N., McGhee L., Meyers S. (2003). The ETO (MTG8) gene family.Gene.303: 1—10.PMID 12559562doi:10.1016/S0378-1119(02)01172-1
Rossetti S., Hoogeveen A.T., Sacchi N. (2004). The MTG proteins: chromatin repression players with a passion for networking.Genomics.84: 1—9.PMID 15203199doi:10.1016/j.ygeno.2004.02.011
Lindberg S.R., Olsson A., Persson A.-M., Olsson I. (2005). The leukemia-associated ETO homologues are differently expressed during hematopoietic differentiation.Exp. Hematol.33: 189—198.PMID 15676213doi:10.1016/j.exphem.2004.10.011

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1537 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, O75081 (англ.) . Архіворигіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 16

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR^[en] α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=CBFA2T3&oldid=43416474

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭