ATOH1 Ідентифікатори Символи ATOH1 , ATH1, HATH1, MATH-1, bHLHa14, atonal bHLH transcription factor 1Зовнішні ІД OMIM :601461 MGI: 104654 HomoloGene: 31297 GeneCards: ATOH1 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • клітинне ядро
Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • regulation of neuron differentiation • auditory receptor cell fate determination • диференціація клітин • positive regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of inner ear receptor cell differentiation • negative regulation of apoptotic process • neuron migration • auditory receptor cell fate specification • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • axon guidance • multicellular organism development • central nervous system development • brain development • inner ear auditory receptor cell differentiation • inner ear morphogenesis • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • cerebral cortex development • inner ear development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 4: 93.83 – 93.83 Mb Хр. 6: 64.71 – 64.71 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ATOH1 (англ. Atonal bHLH transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354амінокислот , амолекулярна маса — 38 160[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSRLLHAEEW AEVKELGDHH RQPQPHHLPQ PPPPPQPPAT LQAREHPVYP PELSLLDSTD PRAWLAPTLQ GICTARAAQY LLHSPELGAS EAAAPRDEVD GRGELVRRSS GGASSSKSPG PVKVREQLCK LKGGVVVDEL GCSRQRAPSS KQVNGVQKQR RLAANARERR RMHGLNHAFD QLRNVIPSFN NDKKLSKYET LQMAQIYINA LSELLQTPSG GEQPPPPPAS CKSDHHHLRT AASYEGGAGN ATAAGAQQAS GGSQRPTPPG SCRTRFSAPA SAGGYSVQLD ALHFSTFEDS ALTAMMAQKN LSPSLPGSIL QPVQEENSKT SPRSHRSDGE FSPHSHYSDS DEAS
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,білків розвитку . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції , диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші