ATF7 Ідентифікатори Символи ATF7 Зовнішні ІД OMIM :606371 MGI: 2443472 HomoloGene: 4994 GeneCards: ATF7 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • enzyme binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • mitogen-activated protein kinase binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear periphery • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 12: 53.51 – 53.63 Mb Хр. 15: 102.43 – 102.53 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ATF7 (англ. Activating transcription factor 7 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 52 967[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MGDDRPFVCN APGCGQRFTN EDHLAVHKHK HEMTLKFGPA RTDSVIIADQ TPTPTRFLKN CEEVGLFNEL ASSFEHEFKK AADEDEKKAR SRTVAKKLVA AAGPLDMSLP STPDIKIKEE EPVEVDSSPP DSPASSPCSP PLKEKEVTPK PVLISTPTPT IVRPGSLPLH LGYDPLHPTL PSPTSVITQA PPSNRQMGSP TGSLPLVMHL ANGQTMPVLP GPPVQMPSVI SLARPVSMVP NIPGIPGPPV NSSGSISPSG HPIPSEAKMR LKATLTHQVS SINGGCGMVV GTASTMVTAR PEQSQILIQH PDAPSPAQPQ VSPAQPTPST GGRRRRTVDE DPDERRQRFL ERNRAAASRC RQKRKLWVSS LEKKAEELTS QNIQLSNEVT LLRNEVAQLK QLLLAHKDCP VTALQKKTQG YLESPKESSE PTGSPAPVIQ HSSATAPSNG LSVRSAAEAV ATSVLTQMAS QRTELSMPIQ SHVIMTPQSQ SAGR
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус ,транскрипція , регуляціятранскрипції ,альтернативний сплайсинг . Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку ,ДНК . Локалізований уцитоплазмі ,ядрі .
Gaire M., Chatton B., Kedinger C. (1990).Isolation and characterization of two novel, closely related ATF cDNA clones from HeLa cells .Nucleic Acids Res .18 : 3467—3473. PMID 1694576 doi :10.1093/nar/18.12.3467 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Hai T., Curran T. (1991). Cross-family dimerization of transcription factors Fos/Jun and ATF/CREB alters DNA binding specificity.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .88 : 3720—3724. PMID 1827203 doi :10.1073/pnas.88.9.3720 Pescini R., Kaszubska W., Whelan J., DeLamarter J.F., Hooft van Huijsduijnen R. (1994).ATF-a0, a novel variant of the ATF/CREB transcription factor family, forms a dominant transcription inhibitor in ATF-a heterodimers .J. Biol. Chem .269 : 1159—1165. PMID 8288576
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
