ATF4 Ідентифікатори Символи ATF4 Зовнішні ІД OMIM :604064 MGI: 88096 HomoloGene: 1266 GeneCards: ATF4 Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • leucine zipper domain binding • protein heterodimerization activity • protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента • цитоплазма • ATF1-ATF4 transcription factor complex • ATF4-CREB1 transcription factor complex • transcription regulator complex • dendrite membrane • клітинне ядро • Lewy body core • nuclear periphery • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • neuron projection • цитоскелет • CHOP-ATF4 complex • центросома • GO:0009327 protein-containing complex • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес • gamma-aminobutyric acid signaling pathway • глюконеогенез • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death • cellular response to amino acid starvation • mRNA transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • response to manganese-induced endoplasmic reticulum stress • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of neuron apoptotic process • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • циркадний ритм • negative regulation of potassium ion transport • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance • cellular response to glucose starvation • negative regulation of translational initiation in response to stress • ритмічний процес • cellular response to UV • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • cellular amino acid metabolic process • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • positive regulation of transcription by RNA polymerase I • cellular response to dopamine • response to toxic substance • neuron differentiation • cellular response to oxygen-glucose deprivation • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • cellular calcium ion homeostasis • positive regulation of biomineral tissue development • negative regulation of cold-induced thermogenesis • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process • positive regulation of sodium-dependent phosphate transport
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 22: 39.52 – 39.52 Mb Хр. 15: 80.14 – 80.14 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ATF4 (англ. Activating transcription factor 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 38 590[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MTEMSFLSSE VLVGDLMSPF DQSGLGAEES LGLLDDYLEV AKHFKPHGFS SDKAKAGSSE WLAVDGLVSP SNNSKEDAFS GTDWMLEKMD LKEFDLDALL GIDDLETMPD DLLTTLDDTC DLFAPLVQET NKQPPQTVNP IGHLPESLTK PDQVAPFTFL QPLPLSPGVL SSTPDHSFSL ELGSEVDITE GDRKPDYTAY VAMIPQCIKE EDTPSDNDSG ICMSPESYLG SPQHSPSTRG SPNRSLPSPG VLCGSARPKP YDPPGEKMVA AKVKGEKLDK KLKKMEQNKT AATRYRQKKR AEQEALTGEC KELEKKNEAL KERADSLAKE IQYLKDLIEE VRKARGKKRV P
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція , регуляціятранскрипції , біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уклітинній мембрані ,цитоплазмі ,цитоскелеті ,ядрі , мембрані.
Karpinski B.A., Morle G.D., Huggenvik J., Uhler M.D., Leiden J.M. (1992). Molecular cloning of human CREB-2: an ATF/CREB transcription factor that can negatively regulate transcription from the cAMP response element.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .89 : 4820—4824. PMID 1534408 doi :10.1073/pnas.89.11.4820 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers.Genes Dev .3 : 2083—2090. PMID 2516827 doi :10.1101/gad.3.12b.2083 Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K., Hayashi H. (2005). TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death.EMBO J .24 : 1243—1255. PMID 15775988 doi :10.1038/sj.emboj.7600596 Su N., Kilberg M.S. (2008).C/EBP homology protein (CHOP) interacts with activating transcription factor 4 (ATF4) and negatively regulates the stress-dependent induction of the asparagine synthetase gene .J. Biol. Chem .283 : 35106—35117. PMID 18940792 doi :10.1074/jbc.M806874200 Shoval Y., Berissi H., Kimchi A., Pietrokovski S. (2011). New modularity of DAP-kinases: alternative splicing of the DRP-1 gene produces a ZIPk-like isoform.PLoS ONE .6 : E17344—E17344. PMID 21408167 doi :10.1371/journal.pone.0017344
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
