ATF3 Ідентифікатори Символи ATF3 Зовнішні ІД OMIM :603148 MGI: 109384 HomoloGene: 1265 GeneCards: ATF3 Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein heterodimerization activity • identical protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента • ядерце • нуклеоплазма • CHOP-ATF3 complex • клітинне ядро
Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of cell population proliferation • skeletal muscle cell differentiation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance • глюконеогенез • cellular response to amino acid starvation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • PERK-mediated unfolded protein response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Відповідь на незгорнуті білки • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії Більше даних Ортологи Види Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (білок) Локус (UCSC) Хр. 1: 212.57 – 212.62 Mb Хр. 1: 190.9 – 190.95 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ATF3 (англ. Activating transcription factor 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , амолекулярна маса — 20 576[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MMLQHPGQVS ASEVSASAIV PCLSPPGSLV FEDFANLTPF VKEELRFAIQ NKHLCHRMSS ALESVTVSDR PLGVSITKAE VAPEEDERKK RRRERNKIAA AKCRNKKKEK TECLQKESEK LESVNAELKA QIEELKNEKQ HLIYMLNLHR PTCIVRAQNG RTPEDERNLF IQQIKEGTLQ S
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів ,фосфопротеїнів . Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція , регуляціятранскрипції , поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування зДНК . Локалізований уядрі .
Pan Y., Chen H., Siu F., Kilberg M.S. (2003).Amino acid deprivation and endoplasmic reticulum stress induce expression of multiple activating transcription factor-3 mRNA species that, when overexpressed in HepG2 cells, modulate transcription by the human asparagine synthetase promoter .J. Biol. Chem .278 : 38402—38412. PMID 12881527 doi :10.1074/jbc.M304574200 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers.Genes Dev .3 : 2083—2090. PMID 2516827 doi :10.1101/gad.3.12b.2083 Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.Genome Biol .5 : R8.1—R8.16. PMID 14759258 doi :10.1186/gb-2004-5-2-r8 Chen B.P.C., Liang G., Whelan J., Hai T. (1994).ATF3 and ATF3 delta Zip. Transcriptional repression versus activation by alternatively spliced isoforms .J. Biol. Chem .269 : 15819—15826. PMID 7515060 Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1990).Genes Dev .4 : 682—682. {{cite journal }}:Пропущений або порожній|title= (довідка )
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
