Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

ARNT

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

ARNT

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
4PKY,1X0O,2A24,2B02,2HV1,2K7S,3F1N,3F1O,3F1P,3H7W,3H82,4EQ1,4GHI,4GS9,4H6J,4LPZ,4XT2

Ідентифікатори

Символи

ARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator

Зовнішні ІД

OMIM:126110 MGI:88071 HomoloGene:1261 GeneCards:ARNT

Онтологія гена
Молекулярна функція	•sequence-specific DNA binding •DNA binding •protein dimerization activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0001105 transcription coactivator activity •aryl hydrocarbon receptor binding •transcription factor binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •protein heterodimerization activity •transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •protein homodimerization activity •sequence-specific double-stranded DNA binding •GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента	•цитоплазма •transcription regulator complex •нуклеоплазма •RNA polymerase II transcription regulator complex •клітинне ядро •ядерні тільця
Біологічний процес	•positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway •диференціація клітин •response to hypoxia •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •positive regulation of endothelial cell proliferation •regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress •positive regulation of erythrocyte differentiation •embryonic placenta development •mRNA transcription by RNA polymerase II •positive regulation of protein sumoylation •transcription, DNA-templated •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •intracellular receptor signaling pathway •regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia •positive regulation of vascular endothelial growth factor production •positive regulation of glycolytic process •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •positive regulation of hormone biosynthetic process •ксенобіотичний метаболізм
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


405


11863

Ensembl


ENSG00000143437


ENSMUSG00000015522

UniProt


P27540


P53762

RefSeq (мРНК)

NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426
NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226


NM_001037737 NM_009709

RefSeq (білок)

NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514
NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155


NP_001032826 NP_033839

Локус (UCSC)

Хр. 1: 150.81 – 150.88 Mb

Хр. 3: 95.34 – 95.4 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARNT (англ.Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 789амінокислот, амолекулярна маса — 86 636^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATTANPEM	TSDVPSLGPA	IASGNSGPGI	QGGGAIVQRA	IKRRPGLDFD
DDGEGNSKFL	RCDDDQMSND	KERFARSDDE	QSSADKERLA	RENHSEIERR
RRNKMTAYIT	ELSDMVPTCS	ALARKPDKLT	ILRMAVSHMK	SLRGTGNTST
DGSYKPSFLT	DQELKHLILE	AADGFLFIVS	CETGRVVYVS	DSVTPVLNQP
QSEWFGSTLY	DQVHPDDVDK	LREQLSTSEN	ALTGRILDLK	TGTVKKEGQQ
SSMRMCMGSR	RSFICRMRCG	SSSVDPVSVN	RLSFVRNRCR	NGLGSVKDGE
PHFVVVHCTG	YIKAWPPAGV	SLPDDDPEAG	QGSKFCLVAI	GRLQVTSSPN
CTDMSNVCQP	TEFISRHNIE	GIFTFVDHRC	VATVGYQPQE	LLGKNIVEFC
HPEDQQLLRD	SFQQVVKLKG	QVLSVMFRFR	SKNQEWLWMR	TSSFTFQNPY
SDEIEYIICT	NTNVKNSSQE	PRPTLSNTIQ	RPQLGPTANL	PLEMGSGQLA
PRQQQQQTEL	DMVPGRDGLA	SYNHSQVVQP	VTTTGPEHSK	PLEKSDGLFA
QDRDPRFSEI	YHNINADQSK	GISSSTVPAT	QQLFSQGNTF	PPTPRPAENF
RNSGLAPPVT	IVQPSASAGQ	MLAQISRHSN	PTQGATPTWT	PTTRSGFSAQ
QVATQATAKT	RTSQFGVGSF	QTPSSFSSMS	LPGAPTASPG	AAAYPSLTNR
GSNFAPETGQ	TAGQFQTRTA	EGVGVWPQWQ	GQQPHHRSSS	SEQHVQQPPA
QQPGQPEVFQ	EMLSMLGDQS	NSYNNEEFPD	LTMFPPFSE

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить доактиваторів. Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція, регуляціятранскрипції. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

Wang G.L., Jiang B.-H., Rue E.A., Semenza G.L. (1995). Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.92: 5510—5514.PMID 7539918doi:10.1073/pnas.92.12.5510
Reyes H., Reisz-Porszasz S., Hankinson O. (1992).Identification of the Ah receptor nuclear translocator protein (Arnt) as a component of the DNA binding form of the Ah receptor.Science.256: 1193—1195.PMID 1317062doi:10.1126/science.256.5060.1193
Bacsi S.G., Hankinson O. (1996).Functional characterization of DNA-binding domains of the subunits of the heterodimeric aryl hydrocarbon receptor complex imputing novel and canonical basic helix-loop-helix protein-DNA interactions.J. Biol. Chem.271: 8843—8850.PMID 8621524doi:10.1074/jbc.271.15.8843
Nguyen T.A., Hoivik D., Lee J.-E., Safe S. (1999). Interactions of nuclear receptor coactivator/corepressor proteins with the aryl hydrocarbon receptor complex.Arch. Biochem. Biophys.367: 250—257.PMID 10395741doi:10.1006/abbi.1999.1282

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.) . Архіворигіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.[Архівовано 2017-09-21 уWayback Machine.]
↑UniProt, P27540 (англ.) . Архіворигіналу за 7 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 1

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=ARNT&oldid=46628891

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭