Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

AIRE

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

AIRE

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів:PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LRI,1XWH,2KE1,2KFT

Ідентифікатори

Символи

AIRE, AIRE1, APECED, APS1, APSI, PGA1, autoimmune regulator

Зовнішні ІД

OMIM:607358 MGI:1338803 HomoloGene:327 GeneCards:AIRE

Пов'язані генетичні захворювання

autoimmune polyendocrine syndrome type 1^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•DNA binding •RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •GO:0031493 histone binding •chromatin binding •GO:0001104 transcription coregulator activity •translation regulator activity •зв’язування з іоном металу •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •identical protein binding •zinc ion binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	•цитоплазма •внутрішньоклітинний •ядерні тільця •клітинне ядро
Біологічний процес	•GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •transcription, DNA-templated •negative thymic T cell selection •humoral immune response •GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь •regulation of translation •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •transcription by RNA polymerase II •peripheral T cell tolerance induction •central tolerance induction to self antigen •chemokine production •GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна •thymus epithelium morphogenesis •regulation of thymocyte migration
Джерела:Amigo /QuickGO

Шаблонекспресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


326


11634

Ensembl


ENSG00000160224


ENSMUSG00000000731

UniProt


O43918


Q9Z0E3

RefSeq (мРНК)


NM_000383 NM_000658 NM_000659

NM_001271549 NM_001271550 NM_001271551 NM_001271552 NM_001271553
NM_001271554 NM_001271555 NM_001271556 NM_001271557 NM_001271558 NM_001271559 NM_009646

RefSeq (білок)


NP_000374

NP_001258478 NP_001258479 NP_001258480 NP_001258481 NP_001258482
NP_001258483 NP_001258484 NP_001258485 NP_001258486 NP_001258487 NP_001258488 NP_033776

Локус (UCSC)

Хр. 21: 44.29 – 44.3 Mb

Хр. 10: 77.87 – 77.88 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AIRE (англ.Autoimmune regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 545амінокислот, амолекулярна маса — 57 727^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATDAALRRL	LRLHRTEIAV	AVDSAFPLLH	ALADHDVVPE	DKFQETLHLK
EKEGCPQAFH	ALLSWLLTQD	STAILDFWRV	LFKDYNLERY	GRLQPILDSF
PKDVDLSQPR	KGRKPPAVPK	ALVPPPRLPT	KRKASEEARA	AAPAALTPRG
TASPGSQLKA	KPPKKPESSA	EQQRLPLGNG	IQTMSASVQR	AVAMSSGDVP
GARGAVEGIL	IQQVFESGGS	KKCIQVGGEF	YTPSKFEDSG	SGKNKARSSS
GPKPLVRAKG	AQGAAPGGGE	ARLGQQGSVP	APLALPSDPQ	LHQKNEDECA
VCRDGGELIC	CDGCPRAFHL	ACLSPPLREI	PSGTWRCSSC	LQATVQEVQP
RAEEPRPQEP	PVETPLPPGL	RSAGEEVRGP	PGEPLAGMDT	TLVYKHLPAP
PSAAPLPGLD	SSALHPLLCV	GPEGQQNLAP	GARCGVCGDG	TDVLRCTHCA
AAFHWRCHFP	AGTSRPGTGL	RCRSCSGDVT	PAPVEGVLAP	SPARLAPGPA
KDDTASHEPA	LHRDDLESLL	SEHTFDGILQ	WAIQSMARPA	APFPS

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція, регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Pitkaenen J., Vaehaemurto P., Krohn K.J.E., Peterson P. (2001).Subcellular localization of the autoimmune regulator protein. characterization of nuclear targeting and transcriptional activation domain.J. Biol. Chem.276: 19597—19602.PMID 11274163doi:10.1074/jbc.M008322200
Mathis D., Benoist C. (2009). Aire.Annu. Rev. Immunol.27: 287—312.PMID 19302042doi:10.1146/annurev.immunol.25.022106.141532
Anderson M.S., Su M.A. (2016). AIRE expands: new roles in immune tolerance and beyond.Nat. Rev. Immunol.16: 247—258.PMID 26972725doi:10.1038/nri.2016.9
Chakravarty S., Zeng L., Zhou M.-M. (2009). Structure and site-specific recognition of histone H3 by the PHD finger of human autoimmune regulator.Structure.17: 670—679.PMID 19446523doi:10.1016/j.str.2009.02.017

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з AIRE переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:360 (англ.) . Архіворигіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.[Архівовано 2016-04-07 уWayback Machine.]
↑UniProt, O43918 (англ.) . Архіворигіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 21

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=AIRE&oldid=46622502

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭