Movatterモバイル変換

[0]ホーム

Перейти до вмісту

AATF

Редагувати посилання

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

AATF

Ідентифікатори

Символи

AATF, BFR2, CHE-1, CHE1, DED, Apoptosis-antagonizing transcription factor, apoptosis antagonizing transcription factor

Зовнішні ІД

OMIM:608463 MGI:1929608 HomoloGene:40811 GeneCards:AATF

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	•protein domain specific binding •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •leucine zipper domain binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •tau protein binding •RNA binding •protein kinase binding
Клітинна компонента	•цитоплазма •комплекс Ґольджі •клітинне ядро •ядерце
Біологічний процес	•embryonic cleavage •ribosome biogenesis •negative regulation of apoptotic process •cellular response to DNA damage stimulus •GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated •адгезія клітин •negative regulation of amyloid precursor protein biosynthetic process •regulation of mitotic cell cycle •negative regulation of superoxide anion generation •negative regulation of reactive oxygen species metabolic process •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26574


56321

Ensembl


ENSG00000275700 ENSG00000276072


ENSMUSG00000018697

UniProt


Q9NY61


Q9JKX4

RefSeq (мРНК)


NM_012138


NM_019816

RefSeq (білок)


NP_036270


NP_062790

Локус (UCSC)

Хр. 17: 36.95 – 37.06 Mb

Хр. 11: 84.42 – 84.51 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AATF (англ.Apoptosis antagonizing transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 560амінокислот, амолекулярна маса — 63 133^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGPQPLALQ	LEQLLNPRPS	EADPEADPEE	ATAARVIDRF	DEGEDGEGDF
LVVGSIRKLA	SASLLDTDKR	YCGKTTSRKA	WNEDHWEQTL	PGSSDEEISD
EEGSGDEDSE	GLGLEEYDED	DLGAAEEQEC	GDHRESKKSR	SHSAKTPGFS
VQSISDFEKF	TKGMDDLGSS	EEEEDEESGM	EEGDDAEDSQ	GESEEDRAGD
RNSEDDGVVM	TFSSVKVSEE	VEKGRAVKNQ	IALWDQLLEG	RIKLQKALLT
TNQLPQPDVF	PLFKDKGGPE	FSSALKNSHK	ALKALLRSLV	GLQEELLFQY
PDTRYLVDGT	KPNAGSEEIS	SEDDELVEEK	KQQRRRVPAK	RKLEMEDYPS
FMAKRFADFT	VYRNRTLQKW	HDKTKLASGK	LGKGFGAFER	SILTQIDHIL
MDKERLLRRT	QTKRSVYRVL	GKPEPAAQPV	PESLPGEPEI	LPQAPANAHL
KDLDEEIFDD	DDFYHQLLRE	LIERKTSSLD	PNDQVAMGRQ	WLAIQKLRSK
IHKKVDRKAS	KGRKLRFHVL	SKLLSFMAPI	DHTTMNDDAR	TELYRSLFGQ
LHPPDEGHGD

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить дофосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, якацетилювання. Локалізований уядрі.

Література

[ред. |ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14: 2121—2127. 2004.PMID 15489334doi:10.1101/gr.2596504
Guo Q., Xie J. (2004). AATF inhibits aberrant production of amyloid beta peptide 1-42 by interacting directly with Par-4.J. Biol. Chem.279: 4596—4603.PMID 14627703doi:10.1074/jbc.M309811200
Xie J., Guo Q. (2004). AATF protects neural cells against oxidative damage induced by amyloid beta-peptide.Neurobiol. Dis.16: 150—157.PMID 15207272doi:10.1016/j.nbd.2004.02.003

Примітки

[ред. |ред. код]

↑Захворювання, генетично пов'язані з AATF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Сполуки, які фізично взаємодіють з Apoptosis antagonizing transcription factor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑Human PubMed Reference:.
↑Mouse PubMed Reference:.
↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19235 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑UniProt, Q9NY61 (англ.) . Архіворигіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. |ред. код]

Хромосома 17

Це незавершена стаття пробілки.
Ви можетедопомогти проєкту,виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції тавнутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори активації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1^[en] c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2^[en] α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR^[en] α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1)Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT^[en] C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2^[en] EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Отримано зhttps://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=AATF&oldid=43409961

Категорії:

Приховані категорії:

[8]ページ先頭