Japonya'nın prefektörlükleri (Japonca: 都道府県, romanize: Todōfuken),Japonya'nın birinci düzey idari bölümleridir. Ülkede 47 adet prefektörlük bulunmaktadır. Prefektörlüklerin 43 tanesi normal prefektörlük (県,ken), ikisi kentsel prefektörlük (府,fu,Osaka veKyoto), biri bölge (道,dō,Hokkaido) ve biri metropoldür (都,to,Tokyo). Prefektörlükler ilk defa 1868 yılındaMeiji Restorasyonu sırasında kurulmuşlardır.[1]
Her prefektörlükdoğrudan seçilen bir vali (知事,chiji) tarafından yönetilir. Yönetmelik ve bütçeler üyelerinin dört yılda bir seçildiğitek kamaralı bir meclis (議会,gikai) tarafından yürürlüğe konur.
1947 Yerel Özerklik Yasası'na göre her prefektörlükşehirlere (市,shi) veilçelere (郡,gun) ve her ilçekasaba (町,chō/machi) veköylere (村,son/mura) ayrılmaktadır.Hokkaidō ise 14alt prefektörlüğe (支庁,shichō) ayrılmaktadır. Ayrıca bazı prefektörlükler de uzak bölgelerin yönetilebilmesi için alt prefektörlüklere sahiptir. Japonya'nın başkentiTokyo hem şehir hem de prefektörlük özelliklerine sahiptir ve ek olarak23 özel semte (特別区,tokubetsu-ku) ayrılır.