Polymeras är ettenzym (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) som syntetiserar långa kedjor avpolymerer ellernukleinsyror.DNA-polymeras ochRNA-polymeras används för att sätta ihopDNA-respektiveRNA-molekyler genom att kopiera en DNA-mallsträng med basparande interaktioner eller RNA genom halvstegsreplikation.
Ett DNA-polymeras från dentermofila bakterien,Thermus aquaticus ( Taq ) (PDB 1BGX , EC 2.7.7.7) används ipolymeraskedjereaktionen, en viktig teknik inommolekylärbiologin.
Ett polymeras kan vara mallberoende eller malloberoende. Poly-A-polymeras är ett exempel på malloberoende polymeras. Terminalt deoxinukleotidyltransferas är också känt för att ha både malloberoende och mallberoende aktiviteter.
| DNA-polymeras | RNA-polymeras | |
|---|---|---|
| Mallen är DNA | DNA-beroende DNA-polymeras eller vanliga DNA-polymeraser | DNA-beroende RNA-polymeras eller vanliga RNA-polymeraser |
| Mallen är RNA | RNA-beroende DNA-polymeras eller omvänt transkriptas | RNA-beroende RNA-polymeras eller RdRp eller RNA-replikas |
Polymeraser är i allmänhet uppdelade i två superfamiljer, "högerhands" veckade (InterPro : IPR043502) och "dubbel psi beta barrel" (ofta helt enkelt "double-barrel") veckade. Den förra ses i nästan alla DNA-polymeraser och nästan alla virala enkelunderenhetspolymeraser. De är markerade med en bevarad "palm"-domän.[2] Det senare ses i alla RNA-polymeraser med flera underenheter, i cRdRP, och i "familj D"-DNA-polymeraser som finns i archaea.[3][4] "X"-familjen som representeras av DNA-polymeras beta har bara en vag "handflata"-form och anses ibland vara en annan superfamilj (InterPro : IPR043519 ).[5]
Primaser faller i allmänhet inte in i någon av kategorierna. Bakteriella primaser har vanligtvis Toprim-domänen, och är relaterade till topoisomeraser och mitokondriell helicase -glitter.[6] Archae- och eukaryotaprimaser bildar en obesläktad AEP-familj, möjligen besläktad med polymeraspalmen. Båda familjerna är ändå bundna till samma uppsättninghelikaser.[7]
Wikimedia Commons har media som rörPolymeras.
|