Markasit har samma kemiska sammansättning somsvavelkis och förväxlas ofta med detta mineral. Markasit har dock lägre densitet (är lättare) och är sprödare än svavelkis. Markasit spricker lättare och kristalliserar dessutom annorlunda än svavelkis vilket per definition gör den till ett eget mineral. (Jämfördiamant/grafit.)
Somsekundärt mineral bildas markasit genom kemisk omvandling av primära mineral sompyrrhotit ellerkopparkis. Färgen på en färsk yta varierar från blekt gul till vit och har en metallisk lyster. Ytans färg ändras med tiden till gul-brunt.
Markasit kan långsamt sönderfalla till ett vitt pulver. Processen bakom detta sönderfall är dåligt undersökt och drabbar prover endast godtyckligt, somliga kristaller kan klara sig helt från sönderfall. Sönderfallet orsakas av att markasit reagerar medfukt varigenom en reaktion medsvavel skaparsvavelsyra. Syran attackerar andra sulfidmineral i närheten. Vissa forskare har föreslagit attbakterier påskyndar denna process genom att "äta" mineralet.
^Stumm, W.; Morgan, J.J. (1996). ”Kinetics of Redox Processes” (på engelska). Aquatic chemistry – Chemical Equilibria and Rates in Natural Waters. Wiley & Sons