Vid Innocentius bortgång 1406 valdes han enhälligt till efterträdare av kardinalerna, och svor att ommotpåven iAvignon,Benedictus XIII, skulle lägga ner sintiara skulle även han själv göra så. Eftersom såväl Gregorius XII som Benedictus XIII uteblev frånkonciliet i Pisa, valde kardinalerna1409Alexander V till påve, men formellt hade inte Gregorius XII avsatts. Vid en session ikonciliet i Konstanz upphörde Gregorius XII att vara påve1415. Kort därefter utnämndes han tillkardinalbiskop avPorto-Santa Rufina.
