Eukaryoter omfattar traditionelltrikenadjur,växter,svampar, samtprotister, vilket i själva verket är en samlingskategori för eukaryoter som ej passar in i övriga riken. Eukaryoterna kontrasteras motprokaryoterna (bakterier ocharkéer), vilka saknar cellkärna och andra komplexa cellstrukturer.Virus är biologiska enheter som parasiterar på celler och faller utanför denna klassifikation.[källa behövs]
Ordet är bildat avgrekiskans εὖ (eu, ’god’, ’äkta’) och κάρυον (karyon, ’nöt’, ’kärna’) vilket syftar på cellkärnan.[källa behövs]
De äldstafossilen av eukaryoter är 1,8–1,9 miljarder år gamla och har hittats iKina[3], och rimligtvis ligger eukaryoternas ursprung ytterligare något längre tillbaka i tiden, kanske så mycket som tre miljarder år sedan[4].
En typisk djurcells struktur.
Det finns flera olika hypoteser om exakt hur den eukaryota cellen först utvecklades. Inslag avendosymbios, det vill säga att flera olikabakterier gick ihop till en gemensam cell, är ett framträdande inslag i de flesta hypoteser; seendosymbiontteorin. Vad gällermitokondrier ochkloroplaster är endosymbiosen välbelagd och det har i båda fallen gått att identifiera, vilken bakterie som inkorporerats (α-proteobakterier respektivecyanobakterier). Vad gäller cellkärnan är osäkerheten stor och ingen hypotes är allmänt accepterad. Ett endosymbiotiskt ursprung för cellkärnan utgår från enprokaryot, vars cellmembran veckas inåt till dess att det omslutitarvsmassan och bildat kärnmembran ochendoplasmatiskt nätverk. Andra prokaryota bakterier med effektiv energiproduktion ochcyanobakterier medfotosyntes tränger in i cellen och drar med sig lite av cellmembranet, vilket förklarar att mitokondrien och kloroplasten har dubbla membran.Mitokondrien,ribosomen och andraorganeller började fungera tillsammans. Både mitokondrien ochkloroplasten har egen arvsmassa och kopieras självständigt.
Denna indelning är dock föråldrad, och motsvarar inte de faktiska släktskapsförhållandena. Senare arbete, främst meddna-data, pekar snarare på en indelning i fem supergrupper även om alla detaljer mellan och inom grupperna inte är helt klarlagda:[5][6][1]
Därutöver har det föreslagits att eukaryoter kan klassificeras i två större grupper,Unikonta ochBikonta,[7] som härstammar från organismer med en respektive tvåflageller. I det här systemet är ophistokonter och amöbor (Amoebozoa) unikonter, och resten är bikonter.