Elsfleth omnämns första gången 1220 och är därmed en av de äldsta orterna längs nedreWeser (Unterweser). Kring år 860 lärBremens biskopAnsgar ha grundet Elsfleths första kyrka.
På 1100- och 1200-talen var Elsfleth kyrklig centralort för landskapetStedingen och i mitten av 1300-talet kom Elsfleth att tillfallaOldenburg. År 1504 byggdes St. Nicolai-kyrkan som fick sin nuvarande form 1690. Genom att greveAnton Günther började ta ut entullavgift vid Elsfleth för trafiken påWeser så fick orten ett kraftigt uppsving från och med 1624. Tullen togs upp fram till 1820. I maj 1856 fick Elsfleth stadsrättigheter.
Elsfleths ekonomiska historia har präglats av flodernaWeser och Hunte och närheten tillNordsjön. I mitten av 1800-talet utvecklades Elsfleth till den viktigastehamnen iOldenburger Land. I staden fanns som mest 22rederier och 100 fartyg. Flera varv i Elsfleth byggdesegelfartyg. År 1832 grundades navigationsskolan som fortfarande finns kvar i form av en sjöfartsskola.
Närångfartygen gjorde sitt intåg började Elsfleths ekonomiska tillbakagång. Stadens rederier konkurrerades ut.
Elsfleths näringsliv präglas i dag av olika företag, bland annat ettvarv och ett antalrederier. Elsfleth ligger vid järnvägen mellanHude ochNordenham.
I floden Hunte finns en skyddsanläggning mothögvatten ochstormfloder (ett så kallatsperrwerk) vid Elsfleth. Skyddsanläggningen i Elsfleth byggdes 1976–1979 och skyddar även bland annat stadenOldenburg mot översvämningar.
^Alle politisch selbständigen Gemeinden mit ausgewählten Merkmalen am 31.12.2023, Statistisches Bundesamt, 28 oktober 2024,läs online, läst: 16 november 2024.[källa från Wikidata]