Bonaire införlivades som ett så kallateilandgebied år1954 i den nybildade autonoma provinsenNederländska Antillerna. Sedan Nederländska Antillerna upphörde som autonom provins 2010 har Bonaire status som särskild kommun (bijzondere gemeenten) i Nederländerna, utanför någon särskild provins.
Ön är den mellersta i storlek och östligaste geografiskt av de så kalladeABC-öarna och ligger cirka 25 kilometer norr omVenezuela. Huvudön har en area på 288 km² och utanför kusten ligger den lilla obebodda önKlein Bonaire med en area på 6 km². Bonaire är övervägande låglänt i söder och något bergigt i norr med högsta punktenBrandaris cirka 240 meter över havet.
HuvudortenKralendijk ligger på öns södra sida strax norr om flygplatsen Flamingo International Airport, övriga större orter är Rincon och Sorobon.
