Anders Kaliff har publicerat vetenskapliga och populärvetenskapliga skrifter, främst inom området forntida religion, föreställningsvärld och begravningsritual.
Kaliff, Anders (1997) (avhandling). Grav och kultplats : eskatologiska föreställningar under yngre bronsålder och äldre järnålder i Östergötland. Uppsala universitet. Institutionen för arkeologi och antik historia
Kaliff, Anders (1999). Arkeologi i Östergötland : scener ur ett landskaps förhistoria. Uppsala universitet. Institutionen för arkeologi och antik historia
Kaliff, Anders och Richard Holmgren (2003). Arkeologer i Bibelns Sodom : svenska Dödahavs-expeditionen till Jordanien. Wahlström & Widstrand
Kaliff, Anders och Olof Sundqvist (2004). Oden och Mithraskulten : religiös ackulturation under romersk järnålder och folkvandringstid. Uppsala universitet. Institutionen för arkeologi och antik historia
Kaliff, Anders (2007). Fire, water, heaven and earth : ritual practice and cosmology in ancient Scandinavia : an Indo-European perspective. Riksantikvarieämbetet