Movatterモバイル変換

[0]ホーム
URL:

Пређи на садржај
Википедија
Претрага

PDZ domen

С Википедије, слободне енциклопедије
Molekulska struktura PDZ domena uključujući ljudski GOPC (Goldži-vezani PDZ protein koji sadrži motiv upredene zavojnice)
Identifikatori
SimbolPDZ
PfamPF00595
InterProIPR001478
SMARTPDZ
PROSITEPDOC50106
SCOP1lcy
SUPERFAMILY1lcy
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB;PDBe;PDBj
PDBsumstructure summary

PDZ domen je zajedničkistrukturni domen sa 80-90aminokiselina koji je nađen kodsignalnihproteinabakterija,kvasca,biljki,virusa[1] iživotinja.[2]PDZ jeakronim formiran kombinovanjem prvih slova imena tri proteina — PSD95 (engl.post synaptic density protein), DlgA (engl.Drosophila disc large tumor suppressor), i zo-1 (engl.zonula occludens-1 protein) — za koje su prvo otkriveno da imaju zajednički domen. PDZ domeni su se ranije nazivaliDHR (Dlg homolognim regionom)[3] iliGLGF (glicin-leucin-glicin-fenilalanin) domenima. Ti domeni pomažu vezivanjetransmembranskih proteina zacitoskelet i drže na okupu signalne komplekse[4].

PDZ domeni imaju sposobnost vezivanja za kratki regionC-terminusa drugih specifičnih proteina. Ti kratki regioni se vezuju za PDZ domen putem augmentacije beta ravni. Beta ravan PDZ domena se uvećava dodatkom dodatnog beta lanaca iz vezanog proteina.[5]

Proteini koji sadrže ovaj domen

[уреди |уреди извор]

PDZ domeni su nađeni kod više hiljada poznatih proteina[6] Ti proteini su široko rasprostranjeni kod eukariota i eubakterija,[7] dok ima veoma malo primera tih proteina kodArchaebacteria. PDZ domeni su često sa drugimproteinskim domenima i te kombinacije im omogućavaju da izvršavaju njihove specifične funkcije. Na primer za PDZ domene u PSD-95 proteinima je utvrđeno da su vezani saSH3 domenom iguanilat kinaznim domenom.

Literatura

[уреди |уреди извор]
  1. ^Boxus M, Twizere JC, Legros S, Dewulf JF, Kettmann R, Willems L (2008).„The HTLV-1 Tax interactome”.Retrovirology.5: 76.PMC 2533353 Слободан приступ.PMID 18702816.doi:10.1186/1742-4690-5-76. 
  2. ^Ponting CP (1997).„Evidence for PDZ domains in bacteria, yeast, and plants”.Protein Sci.6 (2): 464—8.PMC 2143646 Слободан приступ.PMID 9041651.doi:10.1002/pro.5560060225. 
  3. ^Ponting CP, Phillips C (1995). „DHR domains in syntrophins, neuronal NO synthases and other intracellular proteins”.Trends Biochem. Sci.20 (3): 102—3.PMID 7535955.doi:10.1016/S0968-0004(00)88973-2. 
  4. ^Ranganathan R, Ross E (1997). „PDZ domain proteins: scaffolds for signaling complexes.”.Curr Biol.7 (12): R770—3.PMID 9382826.doi:10.1016/S0960-9822(06)00401-5. 
  5. ^Cowburn D (1997). „Peptide recognition by PTB and PDZ domains”.Curr. Opin. Struct. Biol.7 (6): 835—8.PMID 9434904.doi:10.1016/S0959-440X(97)80155-8. 
  6. ^Lee HJ, Zheng JJ (2010).„PDZ domains and their binding partners: structure, specificity, and modification”.Cell Commun. Signal.8: 8.PMC 2891790 Слободан приступ.PMID 20509869.doi:10.1186/1478-811X-8-8. 
  7. ^Ponting CP (1997).„Evidence for PDZ domains in bacteria, yeast, and plants”.Protein Sci.6 (2): 464—8.PMC 2143646 Слободан приступ.PMID 9041651.doi:10.1002/pro.5560060225. 

Dodatna literatura

[уреди |уреди извор]
  • Ponting CP, Phillips C, Davies KE, Blake DJ (1997). „PDZ domains: targeting signalling molecules to sub-membranous sites”.Bioessays.19 (6): 469—79.PMID 9204764.doi:10.1002/bies.950190606. 
  • Doyle DA, Lee A, Lewis J, Kim E, Sheng M, MacKinnon R (1996). „Crystal structures of a complexed and peptide-free membrane protein-binding domain: molecular basis of peptide recognition by PDZ”.Cell.85 (7): 1067—76.PMID 8674113.doi:10.1016/S0092-8674(00)81307-0. 

Spoljašnje veze

[уреди |уреди извор]
BAR • BIR • BZIP • CARD • C1 • C2 • DED • ENTH • FYVE • HEAT • Kringl • LIM • LRR • NACHT • PAS • PDZ • Pirin • PH • PX • SH2 • SH3 • SUN • TRIO • WD40 • Cinkov prst
Преузето из „https://sr.wikipedia.org/w/index.php?title=PDZ_domen&oldid=27557394”
Категорије:
Сакривена категорија:
[8]ページ先頭
©2009-2025 Movatter.jp